[发明专利]用于监控A/J近交系小鼠遗传质量的方法、引物组及其应用

说明书

本发明提供了一种用于监控A/J近交系小鼠遗传质量的方法、引物组及其应用，其包括检测待测小鼠的特异性SNP位点的基因型，以快速高效地从相关近交品系中快速鉴定出A/J品系，从而快速高效地将A/J品系与其他品系的遗传信息有效区分，实现遗传质量监控中杂交品系溯源的检测需求，该方法具有能够采用低成本监控A/J近交系小鼠遗传质量的优点。

技术领域

本发明属于近交系小鼠品系遗传背景鉴定与遗传污染检测领域，涉及一种近交系遗传质量监控的SNP快速检测方法，尤其涉及一种基于KASP法进行A/J近交系小鼠遗传质量监控的检测方法及SNP位点和其引物。

背景技术

实验动物质量控制是实验动物行业健康发展的核心问题，小鼠微生物质量控制及遗传背景质量控制是其中的重要控制因素。国内的遗传质量监控缺少成熟的行业标准，建立一种快速且精准性高的高通量基因分型技术平台至关重要。

用于遗传背景质量控制检测方法主要有3种：生化标记分析法、微卫星DNA、SNP(单核苷酸的多态性)检测等。目前国际所规定的遗传检测方法是生化标记分析法，这一方法是检测同工酶或异构蛋白酶的变化来推测相应的基因变化；使用此方法进行检测，存在准确度低、灵敏度低、检测位点有限、反映遗传概貌有限等弊端。而分子遗传标记可以对实验动物进行更精细的监管，是一种更完善的实验动物质量检测手段；其中SNP检测作为分子遗传标记的一门技术，在基因组水平上检测由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性；SNP所表现的多态性可以监测到单个碱基的变异，具有密度高、代表性、遗传稳定性等特点，能够全面地反映基因组的遗传及变异情况。

KASP法是指竞争性等位基因特异性PCR(KompetitiveAllele Specific PCR)，以高灵敏度的荧光检测为基础，对目标SNPs进行精准的双等位基因分型。与传统Taqman技术不同的是，此种方法无需对靶点即特异性引物/探针进行标记，不需要根据每个SNP位点合成特异的荧光引物，其独特的ARM PCR原理，让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增，大大降低了实验成本。优化的PCR体系可满足不同位点高通量反应的需求，既有金标准的准确，又降低了使用成本，比Taqman具有更好的位点适应性。KASP技术将传统检测等位基因的2个反应合成了1个反应，成本低。SNPs检测不但弥补了传统PCR、切胶、测序流程时间长的缺点，而且大大节省了测序的费用。

本发明设计一套针对特定近交系A/J近交系小鼠品系的基因组SNP监控位点组合及其监控方法，从而实现高效检测实验动物的遗传稳定性及实验稳定性的方法。

发明内容

本发明提供一种用于监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量的方法，其能够快速高效地从相关近交品系中快速鉴定出A/J近交系品系，从而快速高效地将A/J近交系品系与其他品系的遗传信息有效区分，实现遗传质量监控中杂交品系溯源的检测需求，该方法具有能够采用低成本监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量的优点。

本发明还提供一种用于监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量的引物组，该引物组能够有效扩增用于监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量的特异性SNP位点，以达到快速鉴定A/J近交系小鼠及其相关品系的检测目的。

本发明还提供一种用于监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量的试剂盒，其能够快速鉴定A/J近交系小鼠及其相关品系。

本发明还提供上述引物组或试剂盒在监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量中的应用。

本发明是这样实现的：

分子遗传标记可以对实验动物进行精细监管，是一种完善的实验动物质量检测手段，其中，SNP检测作为分子遗传标记的一门技术，在基因组水平检测由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。

本发明实施例提供了一种用于监控A/J近交系近交系小鼠遗传质量的方法，其包括检测待测小鼠如下SNP位点(A/J近交系特异SNP)的基因型：

7 SNP位点(本品系特异)