[发明专利]一种早期准确检测先兆子痫的预测模型

说明书

本发明公开了一种早期准确检测先兆子痫的预测模型。本发明研究发现，外周血游离DNA在基因转录起始位点区域的分布情况能够反应孕妇与胎儿的生理状态，基于基因转录起始位点区域的血清游离DNA丰度在先兆子痫患者与健康孕妇中存在显著差异，对游离DNA丰度进行均一化校正后，使用机器学习算法，通过不同差异基因的优选组合，能够有效预测先兆子痫的发病。因此构建了基于外周血游离DNA预测的先兆子痫的筛查预测模型，以及优化的靶标基因组合，可在先兆子痫临床症状出现之前预测先兆子痫发病，是一种相对无创、经济方便的早期先兆子痫预测的方法，在开发先兆子痫的预测筛查产品方面具有很好的应用前景。

技术领域

本发明属于疾病检测产品技术领域。更具体地，涉及一种早期准确检测先兆子痫的预测模型。

背景技术

先兆子痫(preeclampsia)，又称子痫前期，是一类常见的妊娠期多系统疾病，发病率约为3～8％。先兆子痫的主要特征为孕妇高血压与蛋白尿，重度患者伴随全身多器官损害或功能衰竭，严重者可出现孕妇抽搐、昏迷、甚至死亡，约占导致孕妇死亡的直接或间接原因的10～15％。虽然先兆子痫的病因并不明确，且除终止妊娠外并无有效治疗方法，但若能尽早发现，及时干预，可以有效降低相关并发症对孕妇的伤害，从而有效预防先兆子痫导致的孕妇死亡。

研究表明，先兆子痫的发病与一系列高危因素有关，包括高血压、高血脂、孕妇高龄、蛋白尿等；此外，一系列生化指标，例如血清中的胎盘生长因子(PLGF)、妊娠相关蛋白A(PAPP-A)、可溶性血管内皮生长因子受体1(sFlt-1)等，也被发现与先兆子痫的发病有一定相关性。受益于以上高危因素的发现，全世界不同研究小组报道了一系列基于生理生化指标的前兆子痫预测方法，但是这些方法大多没有使用独立的孕妇数据进行验证评估，少数的几个经过验证评估的方法，其结果也不尽如人意。这可能是由于这些生理生化指标受多种生理因素的影响，与先兆子痫的关联性不够强，不能完全反映先兆子痫带来的生理变化，从而导致了预测的准确性不足。

因此，亟待研发可准确、早期检测先兆子痫的预测筛查技术。

发明内容

本发明要解决的技术问题是克服现有先兆子痫筛查、预测技术的缺陷和不足，提供一种通过外周血游离DNA高通量测序从而预测先兆子痫的技术。本发明首先构建了一种基于外周血游离DNA检测从而预测先兆子痫的预测模型，并得到了一组适用于基于外周血游离DNA预测筛查先兆子痫的靶标基因组合，优化了预测模型。本发明技术可在先兆子痫临床症状出现之前预测先兆子痫发病，是一种相对无创、经济方便且早于现有方法的先兆子痫预测的方法。

本发明的目的是提供一种适用于基于外周血游离DNA预测先兆子痫的靶标基因组合。

本发明的另一目的是提供一种基于外周血游离DNA检测的先兆子痫的预测模型。

本发明上述目的通过以下技术方案实现：

本发明研究发现，外周血游离DNA在基因转录起始位点区域的分布情况能够反应孕妇与胎儿的生理状态，即虽然先兆子痫患者在怀孕12～20周尚未出现临床症状，但此时患者与健康孕妇血清游离DNA在染色体上的分布已存在显著不同，部分基因转录起始位点区域的血清游离DNA丰度在先兆子痫患者与健康孕妇中存在显著差异。同时本发明对游离DNA丰度进行均一化校正后，使用机器学习算法，通过不同差异基因的优选组合，能够有效预测先兆子痫的发病。基于此可以通过孕妇外周血游离DNA高通量测序，预测先兆子痫，可以为先兆子痫的早期预测提供有效的方法。

本发明基于研究结果提供了基于外周血游离DNA检测的先兆子痫的筛查预测模型，同时优化了相关靶标基因组合。

一种适用于基于外周血游离DNA检测的先兆子痫预测的靶标基因组合，具体是NFKB2、EHBP1L1、AMOTL1、VSIG10、USP10、ZSWIM4、ZNF565、BZW1、ATP6V1E2、CDX1中的任意几种。