[发明专利]一种马口鱼DNA条形码序列及其应用在审
申请号: | 201910647588.2 | 申请日: | 2019-07-17 |
公开(公告)号: | CN110438241A | 公开(公告)日: | 2019-11-12 |
发明(设计)人: | 熊飞;曹梦西;王莹;刘红艳;文涵宇 | 申请(专利权)人: | 江汉大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京华沛德权律师事务所 11302 | 代理人: | 房德权 |
地址: | 430056 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 马口鱼 标准检测序列 物种鉴定 应用 | ||
本发明公开了一种马口鱼DNA条形码序列及其应用,属于物种鉴定技术领域。该所述马口鱼DNA条形码为马口鱼COI基因,该DNA条形码序列可以作为马口鱼DNA的标准检测序列,有效的对马口鱼特有种进行鉴定。
技术领域
本发明属于物种鉴定技术领域,具体涉及一种马口鱼DNA条形码序列及其应用。
背景技术
物种鉴定一直是分类学乃至几乎所有生物领域上的研究至关重要的基础步骤。因此,准确的对物种鉴定和分类就显得尤其重要。目前,各国研究者已经开展了从湖泊到海洋不同地理区域的鱼类DNA条形码研究计划,研究表明DNA条形码在物种鉴定方面具有高效可行性。大量的研究结果显示以COI基因为标记的DNA条形码能够准确的对各类动物进行物种鉴定,可以选用COI基因作为各种动物条形码数据库的标准条形码。
DNA条形码是指生物体内能够代表该物种的、有足够变异的、标准的、易扩增并且相对较短的DNA片段。DNA条形码技术就像在零售业中运用的商品条形码一样,通过对物种的一个或多个基因进行扫描,建立起DNA序列和生物物种之间相互对应的关系,从而可以快速、准确的进行物种鉴定。线粒体DNA的COI基因具有长度适中、进化速率适中和富含系统进行发育信息等特点。在研究中,能够较好地对物种的COI基因片段进行有效扩增。因此,在动物物种分类和鉴定中,COI基因作为条形码应用有很大的潜力。
利用传统形态鉴定方法具有一定的局限性,比如会受到物种性别、发育阶段、表型可塑性等因素的影响而导致不正确的鉴定等。在实际操作中,也会遇到标本量较少以及样本保存不完整等问题,导致不正确的鉴定。采用DNA条形码结合传统的分类学方法,对物种高效准确的鉴定和分类起着重要的作用。
马口鱼(Opsariichthys bidens),隶属鲤形目(Cypriniformes),鲤科(Cyprinidae),亚科(Danioninae),马口鱼属(Opsariichthys)。马口鱼多生活于溪流及水库等清澈水体中,尤其喜在水流较急的浅滩、底质为砂石的小溪和江河支流中集群生活,以小鱼、小虾、水生昆虫等为食,马口鱼肉质与品味俱佳,深受消费者青睐。近年来,马口鱼自然资源因过度利用及栖息地水环境污染等原因而衰退,因此种质资源的保护引起了重视,有必要对其种质进行准确有效的鉴定。
在现有的技术中,均没有马口鱼DNA条形码标准检测序列以及马口鱼COI基因作为马口鱼DNA条形码标准检测序列的记载和报道。
发明内容
本发明目的是提供一种可以作为马口鱼DNA的标准检测序列,能够有效的对马口鱼特有种进行鉴定。
本发明所采用的技术方案是:
一种马口鱼DNA条形码序列,序列为SEQ ID NO.1,具体序列为:
优选地,所述马口鱼DNA条形码为马口鱼COI(cytochrome c oxidase subunit I,细胞色素c氧化酶亚基I)基因。
该DNA条形码序列可以作为马口鱼DNA的标准检测序列,有效的对马口鱼特有种及其样本进行鉴定。
本发明具有以下优点:
(1)本发明所得到的马口鱼DNA条形码序列可以作为马口鱼DNA的标准检测序列,对马口鱼特有种高效和准确的进行和分类,同时利用该DNA条形码序列对马口鱼样品进行鉴定,步骤少、方法简单。
(2)在实际操作中,该马口鱼DNA条形码便于保存,方便比对。
(3)马口鱼肉质与品味俱佳,深受消费者青睐,但因自然资源因过度利用及栖息地水环境污染等原因马口鱼物种衰退,本发明技术方案可以对马口鱼物种进行有效的保护。
具体实施方式
实施例1
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