[发明专利]一种棉花纤维长度主效QTL qFL-chr.5的鉴定方法及应用在审

专利信息
申请号: 201910643333.9 申请日: 2019-07-16
公开(公告)号: CN110331227A 公开(公告)日: 2019-10-15
发明(设计)人: 曹志斌;王有武;袁林峰;曾博虹;吴晓峰 申请(专利权)人: 江西省农业科学院;塔里木大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 王焕
地址: 330000 江西*** 国省代码: 江西;36
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摘要:
搜索关键词: 棉花纤维 主效QTL 性状 棉花基因组 棉花新品种 分子标记 辅助鉴定 棉花材料 棉花品种 纤维品质 优势品种 优质棉花 育种年限 构建 引物 应用 纤维 检测 预测 培育 进程 发现
【权利要求书】:

1.一种棉花纤维长度主效QTL qFL-chr.5在如下任一项中的应用:

A)鉴定或辅助鉴定棉花纤维长度性状;

B)棉花育种;

所述qFL-chr.5位于棉花5号染色体上BNL3020和NAU2000标记区间内。

2.棉花纤维长度主效QTL qFL-chr.5的SSR分子标记,其特征在于,包括NAU2000或BNL3020;

所述BNL3020是以棉花基因组为模板,BNL3020对应引物扩增出的长度为195-215bp的DNA片段;

BNL3020对应引物包括:

BNL3020-F:5’-GATAGACTAAGGGACATATCTTCTGC-3’(SEQ ID NO.1);

BNL3020-R:5’-TACTTTCTTCCGCAGTCCTT-3’(SEQ ID NO.2);

所述NAU2000是以棉花基因组为模板,NAU2000对应引物扩增出的长度为2995-3005bp的DNA片段;

NAU2000对应的引物包括:

NAU2000-F:5’-GAAAATGTTCCCCTCTTGTG-3’(SEQ ID NO.3);

NAU2000-R:5’-GTCGAAACCAGGGGAAATC-3’(SEQ ID NO.4)。

3.用于鉴定或辅助鉴定棉花纤维长度性状的引物对,其特征在于,所述引物对包括如下a)或b)中至少一种:

a)SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2;

b)SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4。

4.用于鉴定或辅助鉴定棉花纤维长度性状的试剂盒,其特征在于,含有权利要求3所述的引物对。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTP、DNA聚合酶或扩增缓冲液中的至少一种。

6.权利要求2所述的SSR分子标记或权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒在如下任一项中的应用:

A)鉴定或辅助鉴定棉花纤维长度性状;

B)棉花育种。

7.一种鉴定或辅助鉴定棉花纤维长度性状优异个体的方法,其特征在于,检测待测棉花基因组DNA,如果含有NAU2000或BNL3020分子标记中的至少一种,待测棉花为或候选为棉花纤维长度性状优异个体。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,以棉花基因组DNA为模板,PCR扩增检测NAU2000和/或BNL3020;

优选地,BNL3020分子标记的PCR扩增的产物为195-215bp,引物包括:

BNL3020-F:5’-GATAGACTAAGGGACATATCTTCTGC-3’(SEQ ID NO.1);

BNL3020-R:5’-TACTTTCTTCCGCAGTCCTT-3’(SEQ ID NO.2);

优选地,NAU2000分子标记的PCR扩增的产物为2995-3005bp,引物包括:

NAU2000-F:5’-GAAAATGTTCCCCTCTTGTG-3’(SEQ ID NO.3);

NAU2000-R:5’-GTCGAAACCAGGGGAAATC-3’(SEQ ID NO.4)。

9.一种被赋予棉花纤维长度主效QTL qFL-chr.5的棉花品种的构建方法,其特征在于,使qFL-chr.5位于棉花5号染色体上BNL3020和NAU2000标记区间内,得到被赋予棉花纤维长度主效QTL qFL-chr.5的棉花品种。

10.根据权利要求9所述的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)采用权利要求7所述的方法测定供体棉花是否具有遗传决定因子qFL-chr.5,筛选得到包含纤维长度性状优异的供体棉花;

2)任选地对纤维长度性状表型进行验证;

3)选择包含纤维长度性状优异的供体棉花,并将其与受体棉花杂交,以产生包含qFL-chr.5的子代材料;

4)任选地使用步骤3)中所述的子代材料作为原材料,重复步骤1-3)与受体棉花继续回交2-5次,再自交1-5次,以产生其它后代群体;

优选地,所述受体棉花为农学上优良的品种;

优选地,所述供体棉花和/或受体棉花为棉花栽培种,优选为陆地棉栽培品种。

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