[发明专利]一对用于石榴品种鉴定的专用SSR引物及其应用

说明书

本发明公开了一对用于石榴品种鉴定的专用SSR引物PG080，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明提供的引物对PG080多态性高，利用其对22个石榴品种DNA进行扩增，仅HN12可特异性地扩增出159bp的条带，仅SXXA18可特异性地扩增出161bp的条带，仅CY01可特异性地扩增出140bp；还可根据条带大小对AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品种进行区分。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及一对用于石榴品种鉴定的专用SSR引物及其应用。

背景技术

石榴是古老的保健水果，果实富含花青苷、黄酮、安石榴苷等多酚类物质，特别是安石榴苷等鞣花单宁类物质临床医用和保健价值高，具有潜在的抗氧化、抗癌、抗菌等功能，被誉为超级水果，被划为国家规划特色经济林树种之一。石榴在中国有2000多年的栽培历史，不同地域间的引种和品种交换频繁，导致了现有品种间混杂，同物异名或同名异物现象非常普遍。品种混杂，不仅给育种亲本选配带来了困难，对生产中大规模引种也造成了严重影响，一定程度上制约了石榴产业的快速健康发展。因此，开发特异性引物进行石榴品种资源的遗传鉴定对科学合理利用石榴资源有着重要的现实意义。

目前，对石榴品种的鉴定主要是通过表型特征，包括树势、叶、花、果实特征等，这些表型特征易受到环境因素影响。分子标记可以直接检测不同品种或个体在DNA分子水平上的差异，具有较高的多态性和个体特异性，且不受环境和生长阶段影响，能鉴定形态标记所难以鉴定的个体。SSR分子标记数量丰富且随机分布于基因组中，具有等位变异高、检测方便等特点，已被苹果、葡萄、水稻等的品种鉴定上。传统上，SSR标记的开发主要是基于基因组DNA文库或者富含特异微卫星的文库，该方法工作量大且得到的标记数量比较有限；本发明是在石榴全基因组中挖掘特异性强、多态性高的SSR用于品种鉴定，结果对石榴资源的科学合理利用具有重要的参考价值。

发明内容

本发明第一方面提供了一对用于石榴品种鉴定的专用SSR引物PG080，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ IDNO.2所示。

本发明第二方面提供了上述引物对PG080在石榴育种中的应用。

本方面第三方面提供了上述引物对PG080在石榴品种鉴定中的应用。

本发明第四方面提供了上述引物对PG080在石榴HN12、SXXA18、CY01、AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品种鉴定中的应用。

本发明的有益效果：

1.本发明提供的引物对PG080特异性强，利用其对22个石榴品种DNA进行扩增，仅HN12可特异性地扩增出159bp的条带，仅SXXA18可特异性地扩增出161bp的条带，仅CY01可特异性地扩增出140bp的条带。

2.本发明提供的引物对PG080多态性高，除了可根据特异性条带鉴定品种，还可根据条带大小对AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品种进行区分。

3.利用引物对PG080开展的品种鉴定技术具有取材方便、鉴定技术简便快速、结果高度准确稳定的特点。本方法中可以取幼苗或成年植株的叶、花、果实、芽等组织或器官的基因组DNA进行检测，取样不受季节、地点限制。另外，该技术是利用PCR扩增结果进行毛细管电泳即可判读结果，技术简便快捷。检测结果也高度准确稳定。

具体实施方式

下面结合实施例对本发明做更进一步地解释。下列实施例仅用于说明本发明，但并不用来限定本发明的实施范围。

实施例1