[发明专利]与猪饲料转化率相关的分子标记、鉴定及其应用

说明书

本发明公开了一种与猪饲料转化率相关的SNP标记，所述SNP标记位于DHRS4基因的内含子区域，具体为猪基因组版本Ensembl Sscrofa 11.1的7号染色体第75245571位碱基，所述SNP标记具有A/T多态性；所述SNP标记对应的三种基因型分别为TT、TA和AA，基因型为AA的猪相较于基因型为TA和TT的猪具有更低的饲料转化率。本发明所述DHRS4基因及与猪饲料转化率相关的SNP标记的确定，可用于鉴定或辅助鉴定饲料转化率低的猪品种，缩短育种周期，提高育种效率。

技术领域

本发明涉及猪育种技术领域，具体涉及与猪饲料转化率相关的分子标记、鉴定及其应用。

背景技术

畜牧业在现代农业发展中占据着非常重要的地位，其在农业生产中所占有的比值是用来衡量一个国家和地区法发展程度的重要指标。猪肉作为我国最重要的肉类来源，使得生猪养殖产业在我国畜牧业中占据着举足轻重的地位。在养猪业生产中，猪经济性状是指影响猪生产力的性状，主要影响着养猪业的经济生产总值，而饲料成本占养猪总成本的65～75％，因此降低生猪养殖中的饲料消耗、降低饲料成本至关重要。而饲料转化率作为肉猪经济性状的重要指标之一，目前已成为研究的重要方向。

饲料转化率指在性能测定期间每增加1KG体重的产品所消耗的饲料量，饲料转化率越低，说明每生产单位重量的产品所耗用饲料的数量越少，可以显著的减小生产成本，增大养殖场的生产效益。饲料转化率(FCR)受到肉猪摄食过程及活动量、消化吸收能力、环境温度调节、动物代谢和身体组成等不同因素的影响，与平均日增重(ADG)、背膘厚(BF)、剩余采食量(RFI)、系水力和胴体瘦肉率等生长性能和肉质特性有关，极大的影响了猪的生产效率。与饲料转化率相关的基因参与了动物机体众多代谢活动，如甘油三脂的合成、钾离子代谢、调节脂肪细胞的分布状况、肝脏的代谢活动和动物消化道发育等，因此对肉猪饲料转化率相关的基因鉴定可以为肉猪生长性状的遗传改良提供重要的理论依据。

基因标记辅助选择育种，是指利用与目标性状基因紧密连锁的DNA分子标记对目标性状进行基因型选择的一种现代育种方法，具有操作稳定性强、不易受环境因素干扰等优点，可以极大地提高育种效率。其中，如何筛选出与目标性状显著关联的分子标记位点是辅助选择育种技术建立的关键环节。在常见的分子标记技术中，单核苷酸多态性(SNP)应用最为广泛。SNP为第三代遗传标记，主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，具有数量多、分布广泛、高频率、低突变率等优点，适于快速、规模化筛查，现已应用于基因组分析、生物信息自动化检测、简单和复杂疾病的遗传研究、畜牧育种遗传标记研究等方面。

因此，发掘一个与猪饲料转化率相关的基因，同时筛选与猪饲料转化率相关的分子标记、该分子标记的鉴定及其应用是目前亟需解决的问题。

发明内容

为了克服上述问题，本发明人进行了锐意研究，首先对DHRS4基因在猪不同生长阶段骨骼肌中的表达情况进行检测，然后检测DHRS4基因的多态性并对多态性位点进行基因分型，再将多态性位点与猪重要的生长性状进行关联分析，首次在猪DHRS4基因中获得了与饲料转化率相关的SNP分子标记，用于鉴定或辅助鉴定饲料转化率低的猪品种，提高育种效率，从而完成了本发明。

具体来说，本发明的目的在于提供以下方面：

第一方面，提供了一种与猪饲料转化率相关的SNP标记，其中，所述SNP标记位于DHRS4基因的内含子区域，具体为猪基因组版本Ensembl Sscrofa 11.1的7号染色体第75245571位碱基，所述SNP标记具有A/T多态性。

第二方面，提供了一种第一方面所述的与猪饲料转化率相关的SNP标记的获取方法，其中，所述方法包括以下步骤：

步骤1，获取猪基因组DNA；

步骤2，检测得到SNP位点；

步骤3，对SNP位点进行基因分型；