[发明专利]一种马氏珠母贝生长性状相关的OSR1基因SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种马氏珠母贝生长性状相关的OSR1基因SNP分子标记及应用，属于分子标记辅助育种技术领域；该位点对应于马氏珠母贝锌脂蛋白OSR1基因位点，此处碱基为A或G。本发明SNP标记与马氏珠母贝生长性状(壳高、壳宽与壳重)显著关联，是一个新的分子标记，通过确定待测马氏珠母贝SNP位点基因型，从而对马氏珠母贝生长性状进行早期选育，缩短育种周期，提高遗传进展，节省生产成本，具有明显的经济效益与社会效益。

技术领域

本发明公开了一种马氏珠母贝生长性状相关的OSR1基因SNP分子标记及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。

背景技术

马氏珠母贝Pinctadafucata martensii是我国生产海水有核珍珠的主要贝类。近年来，养殖群体性状退化、海区环境污染与自然灾害等导致了马氏珠母贝海水珍珠质量与产量明显下降。尽管海水珍珠产业链中的品种培育、苗种培育与养殖技术等多个生产环节均存在问题，培育适合当地海区养殖新品种，改良养殖群体的生长与育珠性状，这是解决产业困境的首要任务。目前各科研单位利用传统育种技术已经培育了马氏珠母贝“海优1号”、“南科1号”、“南珍1号”与“海选1号”养殖新品种。尽管马氏珠母贝传统育种取得了较大进展，但这些大都基于对表型性状的选择。表型性状由基因与环境共同决定，环境干扰常常影响选择效果，降低选择的准确性。借鉴作物与畜禽育种技术，发展分子标记辅助育种技术。马氏珠母贝生长性状属于数量性状，由多基因控制，寻找对生长性状具有较大遗传贡献率的基因或分子标记，这是开展分子标记辅助育种的前提条件。

锌指蛋白基因OSR是间介中胚层最早发现的标记基因，并通过多种调控机制参与胚胎的发育。在哺乳动物中，存在两种OSR基因(OSR1和OSR2)，在小鼠胚胎发育过程中，均被检测到，并且在间介中胚层，肾脏和四肢发育过程中广泛存在，说明其在这些发育事件中发挥重要作用。目前，关于OSR1的研究多在胚胎发育以及肿瘤研究领域，其研究在无脊椎动物尤其是在软体动物方面鲜有报道；全组织荧光定量结果显示OSR1在所有组织中均有表达，表明其可在多种组织中起调节作用。

发明内容

本发明提供了一种马氏珠母贝生长性状相关的OSR1基因SNP分子标记及其应用，可通过确定待测马氏珠母贝SNP位点的基因型，从而对马氏珠母贝生长性状(壳高、壳长、壳宽与壳重)进行早期选育，不会受到马氏珠母贝贝龄限制，可有效用于马氏珠母贝的早期选育，缩短选育进程。

本发明所采取的技术方案是：

一种马氏珠母贝生长性状相关的OSR1基因SNP分子标记，所述的SNP标记位于马氏珠母贝OSR1基因A9172G位点，此处碱基为A或G；

所述SNP分子标记在马氏珠母贝早期选育中的应用；

一种马氏珠母贝壳型性状早期选育的方法，根据马氏珠母贝OSR1基因A9172G位点基因型对马氏珠母贝生长性状进行早期选育，包括如下步骤：

(1)提取待测马氏珠母贝的基因组DNA；

(2)设计特异性扩增含有马氏珠母贝OSR1基因A9172G位点的基因片段的引物对；

(3)以步骤(2)设计的引物对马氏珠母贝基因组DNA进行PCR扩增，检测扩增所得基因片段的SNP位点的基因型；

(4)基于SNP位点的基因型对马氏珠母贝壳型性状进行早期选育；

所述的PCR扩增引物序列为：

步骤(1)所述的提取待测马氏珠母贝的基因组DNA的步骤如下：使用试剂盒提取基因组DNA，具体步骤包括：

(1)取0.05g闭壳肌，放入装有200μL缓冲液的高压灭菌过的1.5mL离心管；