[发明专利]一种与马氏珠母贝生长性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与马氏珠母贝生长性状相关的TubB‑4BSNP分子标记及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域；该位点对应于马氏珠母贝微管蛋白TubB‑4B基因位点，此处碱基为G或C。本发明SNP标记与马氏珠母贝生长性状(壳高、壳宽与壳重)显著关联，是一个新的分子标记，通过确定待测马氏珠母贝SNP位点基因型，从而对马氏珠母贝生长性状进行早期选育，缩短育种周期，提高遗传进展，节省生产成本，具有明显的经济效益与社会效益。

技术领域

本发明公开了一种与马氏珠母贝生长性状相关的SNP分子标记及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。

背景技术

选择育种是一种常见的育种技术，现有文献报道了利用群体(或家系)选择改良了栉孔扇贝Chlamys farreri、华贵栉孔扇贝Chlamys nobilis、海湾扇贝Argopectenirradias、长牡蛎Crassostrea gigas与马氏珠母贝P.fuctada martensii等贝类养殖群体的经济性状。马氏珠母贝基础群体或养殖群体存在较高的遗传变异，适宜采用选择育种技术改良目标性状。结合群体与家系选择育种技术，已经培育了“海选1号”、“南科1号”与“南珍1号”养殖新品种，明显改良了养殖群体性状。马氏珠母贝1.5龄达到性成熟，利用传统育种技术培育一个养殖新品种至少需要10年时间。利用分子标记辅助育种技术可进行早期(未达到性成熟)，缩短育种周期。

微管蛋白是构成真核细胞骨架的主要成分之一，有关微管蛋白分为α-，β-，γ-，δ-，ε-，ζ-六种，均参与微管的形成，参与多种修饰过程，包括乙酰化，磷酸化，泛素化等，且对生长发育，变态等生命过程有影响，β-微管蛋白可与多种药物结合，且过表达会使微管不稳定，抑制细胞生长。研究发现TubB-4B基因参与小鼠牙齿发育，全组织荧光定量结果显示TubB-4B在所有组织中均有表达，表明其可在多种组织中起调节作用。利用EGF和IGF两种生长因子分别处理UMR106细胞12h，在促进细胞DNA合成的同时，β-微管蛋白mRNA的表达量明显提高，这表明微管蛋白的合成与细胞增殖间存在相互联系(刘彬等，1995)。

发明内容

本发明提供了一种与马氏珠母贝生长性状相关的TubB-4BSNP分子标记及其应用，可通过确定待测马氏珠母贝SNP位点的基因型，从而对马氏珠母贝生长性状(壳高、壳长、壳宽与壳重)进行早期选育，不会受到马氏珠母贝贝龄限制，可有效用于马氏珠母贝的早期选育，缩短选育进程。

本发明所采取的技术方案是：

一种与马氏珠母贝生长性状相关的TubB-4BSNP分子标记，所述的SNP分子标记位于马氏珠母贝微管蛋白TubB-4B基因的G10009C位点，此处碱基为G或C。

一种与马氏珠母贝生长性状相关的TubB-4BSNP分子标记的应用，所述的SNP分子标记应用于马氏珠母贝早期选育。

SNP分子标记位点的基因型对马氏珠母贝壳型性状进行早期选育。

一种与马氏珠母贝生长性状相关的TubB-4BSNP分子标记的应用，包括如下步骤：

(1)提取待测马氏珠母贝的基因组DNA；

(2)设计特异性扩增含有马氏珠母贝TubB-4B基因10009位点的基因片段的引物对；

(3)以步骤(2)设计的引物对马氏珠母贝基因组DNA进行PCR扩增，检测扩增所得基因片段的SNP位点的基因型；

(4)基于SNP位点的基因型对马氏珠母贝壳型性状进行早期选育。

所述的PCR扩增引物序列为：

步骤(1)所述的提取待测马氏珠母贝的基因组DNA的步骤如下：使用试剂盒提取基因组DNA，具体步骤包括：