[发明专利]基于图论的宫颈癌组织病理学显微图像聚类系统有效
申请号: | 201910531040.1 | 申请日: | 2019-06-19 |
公开(公告)号: | CN110210578B | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
发明(设计)人: | 李晨;胡志杰;蒋涛;许宁 | 申请(专利权)人: | 四川智动木牛智能科技有限公司 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06K9/00 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理有限公司 11369 | 代理人: | 贾晓燕 |
地址: | 610041 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 宫颈癌 组织 病理学 显微 图像 系统 | ||
1.一种基于图论的宫颈癌组织病理学显微图像聚类系统,其特征在于,包括:
步骤一,采集宫颈癌组织显微图像数据,进行第一阶段聚类;
步骤二,对第一阶段聚类的结果进行骨架化处理,以通过骨架化的节点来近似表示细胞核的分布;
步骤三,将节点进行分离处理,将每一个连通的骨架作为一个区域,进而通过每个区域中的骨架节点构造成最小生成树;
步骤四:根据产生的最小生成树结构图,计算不同的统计值,作为图形特征来表示不同的组织;
步骤五:基于提取图形特征和全局特征,进行第二阶段的聚类;
在步骤五中,第二阶段聚类被配置为通过采用k-means算法以实现二次聚类;
其中,二次聚类k-means算法中的k值被配置为3,以通过更详细的聚类结果将组织结构分为三级,有效区分了结构的复杂度以及特殊性,进而预测组织的癌症风险;
还包括步骤六,通过剪影值对聚类结果进行分析评估;
其中,剪影值轮廓的范围被设置为负1到1,其值越高,则说明采用的聚类方法越合适,其值较低或为负值,则表明聚类太多或太少;
在步骤一的第一阶段聚类过程中,采用RGB像素值作为颜色特征,通过应用k-means算法将宫颈组织病理学图像进行初次聚类操作;
其中,将k-means算法中的K值设定为2,且聚类结果通过采用白色代表细胞核区域,黑色代表核以外的区域,进而对细胞核与细胞质、细胞间物质进行区分;
在步骤一中,还包括通过对Sobel边缘检测、Canny边缘检测、Otsu阈值化、分水岭变换的结果进行融合,以提高聚类效果,并通过采用形态学操作来增加聚类的精度;
在步骤二中的骨架化处理过程中,需要对骨架化处理中产生的冗余节点进行删除,进而近似表示细胞核的分布,其中,所述冗余节点进行删除过程被配置为包括:
S1、采用Zhang并行快速细化算法,对每一张形态学处理后的细胞二值图像进行细胞骨架化处理;
S2、对一张图像中具有46个细胞核的待处理组织病理学图像进行骨架化处理,即通过对待处理图像进行灰度化处理,以及通过对该灰度化处理后的图像进行图像分割得到细胞二值图像,再对细胞二值图像进行形态学处理,以使细胞骨架化处理后的图像中骨架化节点数与细胞个数一致;
S3、删除冗余节点,以通过剩下的节点用来近似表示细胞核的分布;
在步骤四中,所提取的图形特征被配置为包括每个区域内边长度以及角度的均值、方差、偏度、峰度;
在步骤五中,所提取的全局特征被配置为包括组织的周长,以及每个组织内节点的独立拟合的参数值。
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