[发明专利]一组NK/T细胞淋巴瘤的基因突变位点群、靶向测序试剂盒及应用

说明书

本发明属于生物技术领域，具体涉及一组NK/T细胞淋巴瘤的基因突变位点群，其试剂盒及应用。本发明提出一组NK/T细胞淋巴瘤的基因突变位点群，可用于评估NK/T细胞淋巴瘤分子分型、预测患者预后、指导患者用药。本发明的试剂盒采用Illumina Miseq测序平台及性能测序，可以高效、准确的检测出一系列NK/TCL疾病相关的突变基因，检测周期短、检测成本低、适用范围广、准确率高。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一组NK/T细胞淋巴瘤的基因突变位点群，其试剂盒及应用。

背景技术

NK/T细胞淋巴瘤(NK/TCL)是一类CD56阳性/胞浆CD3阳性的淋巴细胞恶性增殖性疾病，好发于亚洲地区，与Epstein-Barr病毒(EB病毒)感染密切相关。NK/TCL呈高度恶性，侵袭性强，常规化疗耐药，预后极差，进展期患者五年生存率仅为20％，已成为严重危害人民健康的疾病，给患者本人、家庭和社会带来了深重的负担和痛苦。

NK/TCL的恶性程度高，患者预后差，发病机制尚待阐明。既往的细胞遗传学研究显示，NK/TCL呈现明显的基因组及表观遗传学不稳定性。比较基因组杂交检测表明，NK/TCL在6q等染色体上存在缺失，导致PRDM1、ATG5、AIM1、FOXO3和HACE等抑癌基因的沉默。同时，启动子区域甲基化水平分析亦发现启动子区域普遍呈现高甲基化以及相关基因低表达。在分子生物学层面，之前关注的热点主要集中在TP53和NRAS等已知肿瘤相关基因上，而近年来随着高通量测序技术的发展，关于NK/TCL基因组学研究也有了新进展，新加坡学者对4例NK/TCL进行了外显子组测序，发现JAK3基因p.A572V和p.A573V两个热点突变。美国学者通过测序同样找到了STAT3和STAT5B基因的相关突变。表达谱芯片分析显示，NK/TCL表达异常的基因主要调控NF-κB、MAPK、JAK-STAT等细胞信号通路。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的首要发明目的在于提出一组NK/T细胞淋巴瘤的基因突变位点群.

本发明的第二发明目的在于提出该基因突变位点群的应用。

本发明的第三发明目的在于提出一种靶向测序试剂盒。

本发明的第四发明目的在于提出该靶向测序试剂盒的应用。

为了完成本发明的目的，采用的技术方案为：

本发明提出一组用于评估NK/T细胞淋巴瘤分子分型的基因突变位点群，所述基因突变位点群如表1所示。

本发明提出如表1所示的基因突变位点群作为标记物在制备用于评估NK/T细胞淋巴瘤分子分型的试剂盒中的应用。

本发明提出一组用于评价NK/T细胞淋巴瘤患者预后的基因突变位点群，所述基因突变位点群如表1所示。

本发明提出如表1所示的基因突变位点群作为标记物在制备用于评价NK/T细胞淋巴瘤患者预后的试剂盒中的应用。

本发明提出一组用于指导NK/T细胞淋巴瘤患者用药的基因突变位点群，所述基因突变位点群如表1所示。

本发明提出一组用于筛选用于治疗NK/T细胞淋巴瘤药物的基因突变位点群，其特征在于，所述基因突变位点群如表1所示。

本发明提出如表1所示的基因突变位点群作为靶点在制备用于筛选用于治疗NK/T细胞淋巴瘤药物的试剂盒中的应用。

可选的，所述突变位点群中的所述突变位点的所在染色体、所在基因、突变类型、转录本编号和氨基酸变化信息如表2所示。

本发明提出一种靶向测序试剂盒，其特征在于，所述靶向测序试剂盒中含有用于检测如表1所示的基因突变位点群的试剂；