[发明专利]一种与食管癌患者预后相关的SNP标志物及其应用

说明书

本发明涉及一种与食管癌患者预后相关的SNP标志物及其应用，该标志物为rs2274110。本发明通过针对rs2274110位点进行巧妙的引物和探针设计，能够依靠荧光定量PCR，即可对食管癌患者进行MCM10变异的检测，从而鉴别食管癌患者中的高危个体，辅助食管癌患者总体预后的判断。该技术方法设计巧妙、简易可行、结果准确可靠，可在各级医院进行推广，对于评估食管癌的患病预后情况提供了帮助，有助于临床上对这类食管癌预后较差的患者进行更为主动的治疗和密切的随访。

技术领域

本发明涉及于基因工程及肿瘤医学领域，具体涉及一种与食管癌患者预后相关的SNP标志物及其应用。

背景技术

食管鳞状细胞癌(简称食管癌)是严重威胁我国人民健康的常见恶性肿瘤，食管癌的死亡率位列我国恶性肿瘤第三位。全世界每年新发食管癌病例，有近一半在我国。且食管癌的恶性程度极高，患者的5年生存率不足30％。

目前食管癌的治疗以手术为主，辅以放射治疗和化疗。但这些治疗方法对于食管癌患者总生存的提升仍十分有限。尽管分子靶向药物在一些实体肿瘤中已有较好的应用，但目前，在食管癌治疗中仍没有发现明确有效的分子靶向药物。对于食管癌患者来说，即使是肿瘤分期相同的患者，接受了相同的治疗，其总生存期也存在着巨大的差异。因此，如果能够发现一些与食管癌患者生存期相关的分子标志物，则能够对不同食管癌患者采取不同的治疗方式，尤其对那些可能肿瘤进展迅速的患者，采取更为主动的治疗方式，有助于提升其总生存期。

SNP标志物是一类已被证实与肿瘤预后相关的分子标志物，其反映了个体的遗传背景差异。已有的研究表明，不同的食管癌患者，即使接受了相同的治疗，其预后也有巨大的差异，这很大程度是由其遗传背景的差异造成的。同时，个体遗传背景的差异，也会影响其所患肿瘤本身的侵袭和进展能力，从而与患者的总体预后相关。在以往的一些研究中，已经发现诸如SLC39A6、BRAP等基因的SNP变异，与食管癌患者的生存期显著相关。而我们近期的研究发现，位于MCM10编码区的rs2274110变异与食管癌患者的预后显著相关，有望在临床中应用，作为食管癌患者预后情况判定的分子标志物。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的不足，本发明的目的是提供一种与食管癌患者预后相关的SNP标志物及其应用。

本发明解决上述技术问题的技术方案如下：

一种与食管癌患者预后相关的SNP标志物，该标志物为rs2274110的组合。

上述的与食管癌患者预后相关的SNP标志物的特异性扩增引物，所述rs2274110的特异性扩增引物序列为SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2。

上述的与食管癌患者预后相关的SNP标志物的特异性探针，所述rs2274110的探针序列为SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4。

上述SNP标志物在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用。

一种食管癌预后判断试剂盒，该试剂盒用于检测外周血DNA中的rs2274110。

所述试剂盒还包括上述SNP标志物的特异性扩增引物和上述SNP标志物的特异性探针。

本发明的有益效果为：本发明从分子生物学及基因诊断水平上，提供了鉴别食管癌患者预后情况的技术方法。此方法基于我们前期的研究显示，rs2274110位点与中国人群的食管癌患者的总生存期相关。通过针对rs2274110位点进行巧妙的引物和探针设计，能够依靠荧光定量PCR，即可对食管癌患者进行MCM10变异的检测，从而鉴别食管癌患者中的高危个体，辅助食管癌患者总体预后的判断。该技术方法设计巧妙、简易可行、结果准确可靠，可在各级医院进行推广，对于评估食管癌的患病预后情况提供了帮助，有助于临床上对这类食管癌预后较差的患者进行更为主动的治疗和密切的随访。

附图说明