[发明专利]唾液乳杆菌在抑制猪流行性腹泻病毒增殖中的应用

说明书

本发明公开了唾液乳杆菌(Lactobacillussalivarius)在抑制猪流行性腹泻病毒增殖中的应用。本发明提供了一种提高哺乳仔猪对猪流行性腹泻病毒的抗性的方法，为增加猪消化道中乳杆菌科(Lactobacillaceae)细菌的含量。该方法安全、有效、简便，具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及唾液乳杆菌在抑制猪流行性腹泻病毒增殖中的应用。

背景技术

猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus，PEDV)引起的腹泻是哺乳仔猪的一种灾难性胃肠疾病，具有较高的传染性、发病率和死亡率，给养猪业造成巨大的经济损失。猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea，PED)是由猪流行性腹泻病毒引起的高致病性肠道传染病。PED主要于12月至翌年2月的寒冷季节爆发，被感染的母猪、育肥猪、仔猪都会出现不同程度的发病症状，其中新生仔猪和未断奶仔猪感染后病情最为严重，死亡率能达到80％以上。仔猪感染PEDV后食欲减退，呕吐，出现水样腹泻，严重病例常因腹泻导致严重脱水，进一步死亡。2010年起我国出现了PED爆发，对我国的养猪业造成了巨大的经济损失。

宏基因组(metagenome)是指所有微生物遗传物质的总和。近年来，越来越多的研究表明肠道微生物群在免疫等许多方面起着关键作用，并证明了肠道菌群是防止侵入者通过胃肠道进入的重要屏障。随着测序技术的发展，新一代测序技术的出现使得测序准确度、读长和通量等参数不断改进，测序成本不断下降。基于新一代测序技术的宏基因学分析为利用宏基因组学技术研究微生物的物种分类和功能提供更有利条件。宏基因组测序分析主要包括两种形式，扩增子测序(针对16S rDNA可变区的扩增测序)和全基因组测序(de novo测序)。16S rDNA测序过程是首先从样品中提取全部DNA，接下来选定测序区域设计特定引物扩增16S rRNA基因。测序后，根据基因片段的相似性将16S rDNA序列划分到不同的分类操作单元中(Operational Taxonomic Units，OTUs)，以OTUs为基本单位，与序列注释数据库比对，就可以获得微生物群落的分类学标签、OTUs的相对丰度以及系统发生关系，从而挖掘各个样品之间微生物群落结构的差异。将序列与KEGG(Kyoto Encyclopedia ofGenesand Genomes)等功能性数据库对比，可以进一步分析基因和通路的相对丰度。使用PICRUSt和Genome traits算法，可以推测微生物群落的潜在功能。全基因组测序技术是直接将所有微生物的DNA随机打断成小的片段,通过使用随机引物对全基因组扩增构建文库，进行测序，利用计算机根据序列间的重叠关系进行基因组拼装和基因预测，然后通过基因组数据库的比对进行物种分类和生物学功能注释。虽然宏基因组技术在人类疾病的研究上已经取得了一定的成果，发现了许多可以用于疾病诊断的微生物，但是在猪疾病方面的研究还寥寥无几，且没有进行功能验证，所以在猪抗病育种中的应用仍然十分有限。

目前，虽然市场已有多种PEDV疫苗在售，但由于PEDV变异较快，注射疫苗无法有效应对各种野毒株感染，免疫效果较差，而且成本较高。一些PEDV活毒疫苗甚至有造成猪PEDV感染的风险，安全性较差。

发明内容

本发明的目的是治疗和/或预防猪流行性腹泻。

本发明首先保护乳杆菌科(Lactobacillaceae)细菌的应用，可为A1)-A8)中的至少一种：

A1)抑制PEDV增殖；

A2)制备抑制PEDV增殖的产品；

A3)提高猪对PEDV的抗性；

A4)制备提高猪对PEDV的抗性的产品；

A5)治疗和/或预防因PEDV感染引起的疾病；

A6)制备治疗和/或预防因PEDV感染引起的疾病的产品；