[发明专利]SNP位点的应用及其引物、探针、检测试剂盒

说明书

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及SNP位点的应用及其引物、探针、检测试剂盒，具体提供了40个SNP位点在评估肾移植术后移植物损伤及排斥风险中的应用，通过对移植后受体总游离DNA的40个特定SNP位点进行检测，结合特定的计算方法，最终获得受体游离DNA中供体游离DNA的含量，即GcfDNA供受比，根据GcfDNA供受比快速而准确地判断移植排斥的程度，无需任何侵入式的检测，为临床检测器官移植术后移植物损伤和排斥风险提供了一种简单而有效的辅助手段。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及SNP位点的应用及其引物、探针、检测试剂盒。

背景技术

目前实体器官移植术后移植物的健康监测常采用抽血进行肾功能检查，或穿刺针采集组织进行病理学检查。

对于常规抽血功能检查，其各项指标如肌酐、ALT、AST、胆红素等等灵敏度和特异性均不高，无法准确的反应移植物的健康状况。

对于目前金标准的组织活检，其虽可直接的反应移植物的健康状况。但存在以下重大缺点：

1)侵入式检测，对病人造成较大痛苦，同时对移植物造成损伤；

2)检出异常时，移植物实质性损伤已经发生，并且损伤往往已经较为严重，这时对于临床医生来说拯救移植物往往已经太晚；

3)若穿刺针未采集到移植物的病灶组织部分，会对结果准确性造成较大影响，因此准确性和灵敏度不高。

发明内容

有鉴于此，本申请提供SNP位点的应用及其引物、探针、检测试剂盒，通过对移植后受体总游离DNA的40个特定SNP位点进行检测，最终获得受体游离DNA中供体游离DNA的含量，即GcfDNA供受比，根据GcfDNA供受比快速而准确地判断移植排斥的程度，使得该试剂盒能够灵敏、特异、准确的评估肾移植物的损伤状况和排斥风险，无需进行任何创伤检测。

为解决以上技术问题，本申请提供的技术方案是SNP位点在制备评估肾移植术后移植物损伤及排斥风险的产品中的应用，所述SNP位点为：rs1109341、rs2073623、rs1800880、rs2073702、rs1060376、rs2073804、rs429269、rs215165、rs687621、rs687289、rs392121、rs2073859、rs2073866、rs739442、rs2073874、rs2073900、rs2073973、rs2074000、rs178526、rs2074052、rs2074081、rs41170、rs2074122、rs208563、rs2074152、rs179785、rs28958、rs2074247、rs2074276、rs1799854、rs1264570、rs184949、rs223865、rs1527210、rs2066944、rs2074887、rs1049534、rs977624、rs207699、rs454532。

本发明研究表明，将上述40个SNP位点作为检测靶点，计算得到的受体游离DNA中供体游离DNA的含量(GcfDNA供受比)能够准确反映出移植排斥的程度，为临床检测器官移植术后移植物损伤和排斥风险提供了一种简单而有效的辅助手段。

本发明还提供了一种用于评估肾移植术后移植物损伤及排斥风险的引物及探针，所述引物为：

所述引物为：

用于检测rs1109341的引物，其序列为SEQ ID No：1和SEQ ID No：2；

用于检测rs2073623的引物，其序列为SEQ ID No：3和SEQ ID No：4；

用于检测rs1800880的引物，其序列为SEQ ID No：5和SEQ ID No：6；

用于检测rs2073702的引物，其序列为SEQ ID No：7和SEQ ID No：8；