[发明专利]藏獒分子标记的特异性引物及检测方法

说明书

本发明涉及涉及家犬品种藏獒单核苷酸变异及微卫星标记的特异性引物及检测方法技术领域。本发明方法包括以下步骤，1)提取藏獒基因组DNA和其它家犬基因组DNA；2)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板，使用SNP分子标记引物或引物组分别进行PCR扩增；3)、利用测序仪对PCR扩增产物进行测序；4)检测单核苷酸多态位点的变异情况。本发明提供的一种藏獒分子标记用的特异性引物并交代了详细的检测方法，对藏獒犬的遗传特征、谱系地理格局、群体结构的分析，以及种质资源的科学保护与利用均具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于分子标记技术领域，具体涉及家犬品种藏獒单核苷酸变异及微卫星标记的特异性引物及检测方法技术领域。

背景技术

藏獒(Tibetan Mastiff)隶属于食肉目犬科犬属灰狼种的家犬亚种(Canis lupusfamiliaris)，是青藏高原特有的家犬品种，主要分布于青藏高原及喜马拉雅山脉，包括尼泊尔、印度、不丹。历史上，藏獒主要被当地牧民饲养，用于保护畜牧牲口免于野外捕食动物的侵害。近年来，由于其独特适应高原的表型和能力备受市场追捧，过度贸易、错误引种、随意繁殖、人为炒作等市场行为使藏獒种质资源面临巨大威胁。为了科学保护藏獒种质资源，实现资源的可持续发展与利用，开展该种的特异遗传变异标记及群体遗传特征分析以及分子标记育种具有重要意义。目前，尚未见藏獒遗传分子标记开发的相关报道。

发明内容

本发明正是为了解决上述问题缺陷，提供一种藏獒分子标记用的特异性引物并交代了详细的检测方法，对藏獒犬的遗传特征、谱系地理格局、群体结构的分析，以及种质资源的科学保护与利用均具有重要的应用价值。

本发明采用如下技术方案实现。

一种SNP分子标记引物，本发明该分子标记引物择一包含以下引物对；

TM-P1：F:TGCAAGGAGGAGGAAGAAGG，

R:CTCCCAGTCTCTTGCCTCTG；

TM-P2：F:TGCAAGGAGGAGGAAGAAGG，

R:CTCCCAGTCTCTTGCCTCTG；

TM-E：F:CATTCAGTCAGCATTTCTGC

R:GGGCTGCAGGTTGCGAGGGT；

TM-M：F:TTCTTACATGGCAGCTGGTG，

R:CTTTTCCCTGTGAGCTCTGG；

TM-M1：F:GCTGCAATCCACAATGAAGA，

R:ATGCAGTCAGAACCCCAAGT；

TM-H1：F:GAGGCTTCAAATGCCTTGAG，

R:CATGCCTTAGGGGCAGTAAA；

TM-H2：F:GAGGCTTCAAATGCCTTGAG，

R:CATGCCTTAGGGGCAGTAAA；

TM-C：F:AGTCCCCAGAAGGTTCCATG，

R:GCAACCGGTGGAAAGTTTCT；

TM-S：F:GGCCTCCATGCTTAGCTCTA，

R:AGCACCTTACAGACTCCACC；其中F为上游引物，R为下游引物。