[发明专利]探针组合物、包含其的试剂、试剂盒、检测方法及应用在审
申请号: | 201910407763.0 | 申请日: | 2019-05-16 |
公开(公告)号: | CN110184337A | 公开(公告)日: | 2019-08-30 |
发明(设计)人: | 林志伟;李琳;呼锦涛;徐其隆;王远;李瑞强 | 申请(专利权)人: | 南京诺禾致源生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 路秀丽 |
地址: | 210000 江苏省南京市高新开发区江北新*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 探针组合物 检测 基因 试剂盒 疾病 基因突变 基因位点 疾病检测 突变位点 突变信息 相关信息 筛查 探针 样本 应用 场景 涵盖 申请 | ||
本发明提供了一种探针组合物、包含其的试剂、试剂盒、检测方法及应用。该探针组合物包括检测23种疾病的55个基因中的任意多个或全部基因的探针的组合。最多涵盖了23种疾病的55个基因的相关突变位点,针对如此众多的基因位点的探针组合物便于在一次同时检测多种疾病相关的基因突变相关信息,最多时可同时检测55个基因的所有突变信息。将本申请的探针组合物用于相关疾病检测时,检测效率高、成本低,适合用于对批量样本进行筛查的场景中。
技术领域
本发明涉及基因检测领域,具体而言,涉及一种探针组合物、包含其的试剂、试剂盒、检测方法及应用。
背景技术
现阶段遗传代谢病的筛查还是以串联质谱为代表的传统技术,但由于串联质谱检测单一,只能在遗传代谢病方面发挥优势,其具有假阳性率和假阴性率相对较高,存在对其他类型的单基因遗传病无法进行检测的局限性;绝大部份的疾病诊断和后期优生优育指导更依赖于基因数据进行诊断,主要由于一种代谢物可对应多种疾病,很难对某些疾病亚型做出准确判断,还需要做基因诊断,所以在一些基因可以直接筛查诊断的疾病上,质谱临床路径偏长,时间成本高,临床效率偏低。此外大多数单基因遗传病的基因检测还是以低通量为主,研究某个基因的相关遗传变异。而高通量测序技术在生命科学及医学领域方面的研究和应用,可以高效的分析与挖掘测序得到的基因组大数据,提炼出与疾病相关的遗传变异信息,并为疾病的筛查、治疗和预防提供科学依据。
目标序列捕获是通过将基因组特定区域进行富集后建库测序,目前主流的方法为多重PCR法和液相杂交捕获法。由于多重PCR法由于引物设计的局限性,因此适用于捕获较小的区域,且试剂成本相对较高,不适合批量样本的筛查工作。
基于液相杂交捕获法的高通量测序,适合捕获较大的区域,适合基因的全外显子以及全长的检测。
但目前已公开的对与遗传疾病相关基因进行检测的报道中,有对单一疾病进行检测的,也有同时对单基因遗传病突变位点、染色体疾病以及连锁分析进行检测的,但后者是通过对全基因组扩增以及目的基因突变位点扩增得到的产物同时进行建库测序才能得到的,其主要应用在三代试管婴儿领域,且检测成本以及应用场景不适用于大批量样本筛查工作。此外,还有对22种常见新生儿遗传病相关的基因进行检测的报道,但该方法采用多重PCR捕获技术,成本较高,不适合在批量样本筛查工作中应用。
因此,对批量样本筛查而言,现有技术中还没有成本较低的检测方案。
发明内容
本发明的主要目的在于提供一种探针组合物、包含其的试剂、试剂盒、检测方法及应用,以解决现有技术中难以低成本地对批量样本进行多种遗传病相关基因同时检测的问题。
为了实现上述目的,根据本发明的一个方面,提供了一种探针组合物,探针组合物包括检测如下表1所示的任意多个或全部基因的探针的组合:
表1:
。
进一步地,探针组合物包括检测HBA1基因、HBA2基因和HBB基因的探针的组
合,检测HBA1基因、HBA2基因和HBB基因的探针组合物为覆盖HBA1、HBA2和
HBB基因全长的探针的组合;优选地,检测HBA1基因的探针包括SEQ ID NO:1至SEQ
ID NO:37所示探针;检测HBA2基因的探针包括SEQ ID NO:38至SEQ ID NO:45所示
探针;检测HBB基因的探针包括SEQ ID NO:46至SEQ ID NO:61所示的探针。
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