[发明专利]一个与甜瓜绿色果皮性状相关的APRR2基因

说明书

本申请属于甜瓜基因育种开发技术领域，具体涉及一个与甜瓜绿色果皮性状相关的APRR2基因。该基因长度为1134bp，与甜瓜果皮的绿色性状相关，碱基序列如SEQ ID NO.1所示。本申请同时提供了用于检测APRR2基因的indel分子标记。本申请以黄皮和绿皮材料构建的六世代遗传群体为基础，初步解析了甜瓜果皮颜色的遗传规律，并最终确定了一个与甜瓜绿色果皮形成密切相关的基因。进一步的基因克隆发现该基因在甜瓜白色和黄色果皮材料中存在一个13bp的碱基插入，据此进一步设计了indel标记。总之，该分子标记可用于甜瓜皮色育种中的早期选择。而基于本申请相关研究结果，也可为新的甜瓜品种的培育奠定一定基础。

技术领域

本申请属于甜瓜基因育种开发技术领域，具体涉及一个与甜瓜绿色果皮性状相关的APRR2基因。

背景技术

甜瓜（Cucusis melon L.）是葫芦科（Cucurbitaceae）黄瓜属一年生蔓生草本植物。中国有着悠久的甜瓜栽培历史，也是世界上最大的甜瓜生产和消费大国。据FAO统计，2016年我国甜瓜种植面积达到47.47万hm²，产量占到了世界总产量的51.16%。甜瓜是一个遗传多样性非常丰富的物种，如皮色、果实形状、果实大小。果实皮色不仅是甜瓜果实重要的外观品质，也是影响消费者选择的最直观评价标准。因此，选择符合各地市场需求，具有多样化皮色的甜瓜品种也是育种工作中的一项重要内容。然而现有技术中对于涉及到如果皮颜色、果肉颜色等果实的性状，多数情况下必须等到植株生长后期才能进行选择鉴定，因此周期较长、成本较高。也因此，挖掘控制甜瓜皮色的基因，开发能够用于育种实践的分子标记进行早期选择将大大提高育种选择的效率，降低生产成本。

当前市场上甜瓜的主流皮色为白色、绿色和黄色，其颜色形成主要由植物色素叶绿素、类胡萝卜素和类黄酮等决定。现有关于甜瓜皮色的遗传机制存在不同的研究结论，例如：白立华等（厚皮甜瓜果实主要性状遗传规律的初步研究，北方遗传资源的保护与利用研讨会论文汇编，2010）认为，甜瓜皮色为单基因控制的质量性状，且黄色对绿色和白色为显性；而Monforte 等（Identification of quantitative trait loci involved in fruitquality traits in melon (Cucumis melo, L.)，Theoretical and Applied Genetics,2004）的研究却表明，果皮颜色可能受两个以上具有上位性效应的位点控制。另外，Feder等（A Kelch domain-containing F-box coding gene negatively regulates flavonoidaccumulation in Cucumis melo, plant physiology, 2015）发现甜瓜黄色果皮中有柚皮苷查尔酮积累，并且在10号染色体上定位到一个负调控柚皮苷查尔酮积累的基因（CmKFB），可能控制甜瓜黄色果皮形成。然而，控制甜瓜其他果皮颜色的基因目前尚未被定位。因此，挖掘控制甜瓜皮色的基因、明晰基因内重要的变异位点，进而开发分子标记对于开展甜瓜皮色分子标记辅助育种具有重要意义。

发明内容

本申请目的在于提供一个与甜瓜绿色果皮性状相关的APRR2基因及用于该基因的indel分子标记，从而为甜瓜分子育种奠定一定技术基础。

本申请所采取的技术方案详述如下。

一个与甜瓜绿色果皮性状相关的APRR2基因，该基因长度为1134bp，与甜瓜果皮的绿色性状相关，碱基序列如SEQ ID NO.1所示，具体为：