[发明专利]粪便DNA提取试剂盒有效
申请号: | 201910388938.8 | 申请日: | 2019-05-10 |
公开(公告)号: | CN110016475B | 公开(公告)日: | 2021-07-06 |
发明(设计)人: | 周杰锋 | 申请(专利权)人: | 宁波艾捷康宁生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 杭州恒翌专利代理事务所(特殊普通合伙) 33298 | 代理人: | 王从友 |
地址: | 315048 浙江省宁波市高新*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 粪便 dna 提取 试剂盒 | ||
本发明涉及医疗检测领域,尤其涉及一种粪便DNA提取保存液及保存管、试剂盒和提取方法。一种粪便DNA提取保存液,该保存液包括0.20~0.30M EDTA,0.2~0.8%丙氨酸,20~30%乙醇,0.2~0.8%十二烷基硫酸钠,1.0~5.0%聚乙烯吡咯烷酮,pH 10.0~11.0;上述的百分比为质量百分比。该保存液在高EDTA/碱性的条件下,采用酒精作为杀菌剂,同时采用丙氨酸作为高碱性环境的缓冲体系,并采用十二烷基硫酸钠和聚乙烯吡咯烷酮协同作为洗涤剂和去垢剂,能延长粪便保存时间,粪便离体后立即得到保护,确保了基因的完整性。
技术领域
本发明涉及医疗检测领域,尤其涉及一种粪便DNA提取保存液及保存管、试剂盒和提取方法。
背景技术
结直肠癌是最常见的消化道恶性肿瘤,发生率仅次于胃癌和食道癌。近二十年来结直肠癌的发病率在逐渐增加,同时,其发病年龄趋向老龄化。在西方发达国家,结直肠癌是仅次于肺癌的第二位恶性肿瘤。近年来的一些研究表明K-ras,P53,APC,MMR等一些基因的突变会导致正常结肠黏膜上皮细胞转化成肿瘤细胞(Vogelstein,B.and Kinzler,K.W.,1993),对这些基因突变的研究进展,使得通过粪便DNA检测诊断结直肠癌成为一种可能。而能否高效提取粪便中人基因组DNA成为影响诊断准确性的关键因素。
粪便成分复杂,含有大量多糖、胆酸等对人基因组DNA检测可产生抑制作用的成分,且粪便DNA绝大部分来源于肠道细菌,人源DNA含量很少。所以采集来的粪便样品需尽快保存,目前常用的保存方法一般是低温处理,即冷冻保存。冷冻方法操作复杂,成本高,无法快速便捷采集样本。
另外,试剂盒法是目前临床应用广泛且最简便的方法,商品化的粪便DNA提取试剂盒种类繁多,性能迥异,但粪便人基因组DNA提取效率不同。另外,由于临床粪便样本量大,采集后通常无法及时进行DNA提取即被储存,粪便中含有的大量核酸酶会对粪便DNA造成严重降解,因此,储存时间对人基因组DNA提取效率的影响很大。
如中国发明专利(公开号CN106967712A,公开日:2017.07.21)粪便DNA快速提取试剂盒,该提取试剂原理为:对所提取的粪便用粪便处理液进行前处理,离心除去粪便残渣和吸附去掉部分蛋白等杂质,用磁珠裂解液和蛋白酶K将核酸裂解释放出来,释放出来的核酸特异性的结合到混合了特异性探针的磁珠上,通过1轮洗涤液1和2轮洗涤液2的洗涤后,用洗脱液将核酸从磁珠上洗脱下来并把洗脱后的磁珠弃掉,最后得到粪便基因组。该专利还是重在于如何快速提取,对于如何有效的保存DNA,则不再考虑范围。
也有关于粪便DNA保存的技术,如中国发明专利(CN108866045A,公开日2018.11.23)公开了一种人类粪便DNA提取方法,该方法在人排出粪便后,立即采集2-5g粪便样品放入采集管中,采集管中装有10-15mL粪便保存,所述粪便保持液成分:0.3-0.6MEDTA,3-6M NaCl,0.3-1.5M Tris。中国发明专利(公开号CN107980763A公开日2018.05.04)公开了粪便保存试剂,包括细胞缓冲液、细胞固定剂、金属离子螯合剂和防腐剂;细胞缓冲液为Tris-HCl,工作pH范围为8-10;细胞固定剂选自SDS、Triton X-100和PEG-2000中的至少一种;金属离子螯合剂为EDTA和/或EDTA-Na2;防腐剂为NaCl。这两个技术都是采用Tris-HCl缓冲体系,NaCl作为防腐剂,在实际应用中DNA还是容易降解,对人基因组DNA提取效率的影响很大。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种粪便DNA提取保存液,该保存液在高EDTA/碱性的条件下,采用酒精作为杀菌剂,同时采用丙氨酸作为高碱性环境的缓冲体系,并采用十二烷基硫酸钠和聚乙烯吡咯烷酮协同作为洗涤剂和去垢剂,能延长粪便保存时间,粪便离体后立即得到保护,确保了基因的完整性。
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