[发明专利]一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记在审
申请号: | 201910375741.0 | 申请日: | 2019-05-07 |
公开(公告)号: | CN110747286A | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 黄江;谢文娟;吴钰坡;林军;谭宁 | 申请(专利权)人: | 桂林医学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6879;C12N15/11 |
代理公司: | 11489 北京中政联科专利代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 周鑫 |
地址: | 541004 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 罗汉果 早期鉴定 分子辅助育种 特异性片段 特异性验证 有效的途径 实验材料 退火条件 构建 扩增 制备 克隆 采集 筛选 总长 回收 开发 | ||
1.一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,该SCAR标记为SC343-1.4K-12,其在Genbank的序列号为MK584624。
2.根据权利要求1所述的一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,其制备步骤包括:
S1、实验材料的采集和鉴定;采集罗汉果雌雄单株各30株,其性别均在开花后根据花器官的结构予以确定;
S2、罗汉果DNA的提取;称取罗汉果幼叶0.1g,在液氮中磨碎后提取其总DNA,接着采用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA的质量和完整性,最后进行DNA的定量检测。
S3、构建DNA雌雄池;将DNA稀释至统一浓度,-20℃保存备用;随机选择雌雄单株各10份,取等量DNA混匀构建DNA雌雄池;
S4、RAPD引物筛选;首先用雌雄池对所有的RAPD引物进行第一轮初筛,选择条带有差异的引物;接着利用雌雄单株各10份对其进行第二轮筛选,从中选择对应关系较好的引物;再对所有的雌雄单株进行第三轮筛选验证,最终得到一条雄性特异带;
S5、特异性片段的回收、克隆和测定;从琼脂糖凝胶中挑取该雄性特异条带,利用DNA纯化回收试剂盒进行目的片段的回收和纯化;将目的片段克隆至T载体上并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞;通过蓝白斑筛选挑取白斑菌落,应用菌落PCR确定阳性克隆,摇菌后用质粒小提试剂盒提取质粒进行测序;
S6、SCAR引物的设计及特异性验证;根据DNA测序的结果,在RAPD引物的基础上,向内延伸12bp,设计出相应的SCAR引物SC343-1.4K-12;将引物序列合成;利用该SCAR引物对罗汉果雌雄单株进行特异性的验证。
3.根据权利要求2所述的一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,在S1中,罗汉果雌雄株材料采集地为广西桂林市永福县和临桂区等地。
4.根据权利要求2所述的一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,在S2中,采用改良CTAB法提取罗汉果的DNA。
5.根据权利要求2所述的一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,在S3中,根据混合分离群体分析法原理,构建DNA雌雄池。
6.根据权利要求2所述的一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,在S4中,根据上海生工生物工程有限公司随机引物目录,随机选择10bp的碱基RAPD引物进行RAPD引物筛选。
7.根据权利要求2所述的一种用于罗汉果性别早期鉴定的特异性SCAR标记,其特征在于,在S5中,经克隆测序后,雄性特异条带的实际长度为1373bp。
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