[发明专利]水稻黑条矮缩病抗性QTL qRBSDV-4紧密连锁标记及其应用

说明书

本发明涉及水稻黑条矮缩病抗性QTLqRBSDV‑4紧密连锁标记及其应用。本发明利用T1012与武育粳3号杂交获得F1，在自交后代群体中利用分子标记辅助选择技术构建染色体片段代换系群体，通过田间自然鉴定的方法对代换系群体进行抗性鉴定，获得一个黑条矮缩病抗性位点，命名为qRBSDV‑4，并发展了与qRBSDV‑4紧密连锁的标记STS‑4‑3.1。本发明可以通过检测分子标记STS‑4‑3.1处的带型来预测鉴定材料对水稻黑条矮缩病的抗性，提高抗黑条矮缩病水稻品种的育种效率。以有效开展动物基因功能研究；3）可以介导进行人类基因治疗等。

技术领域

本发明涉及抗黑条矮缩病抗性QTL qRBSDV-4鉴定及其分子标记方法和应用，属于水稻分子育种科学技术领域。

背景技术

水稻黑条矮缩病(rice black-streaked dwarf virus disease,RBSDV)是一种水稻病毒性病害，致病病毒属于呼肠孤病毒科斐济病毒属，该种病害主要由灰飞虱以持久性不经卵的方式进行传播。水稻黑条矮缩病主要分布在东亚国家及地区，如中国、朝鲜、日本等，该病害一度在我国江浙等地较为流行，近几年来在沿黄地区该病害发病较重，对水稻生产造成极大影响。水稻黑条矮缩病侵染植株后的典型症状是病株矮缩，叶色浓绿僵硬，早期叶背、叶鞘和茎秆有蜡白色的短条纹不规则突起，后期转变为黑褐色，重病株甚至不能抽穗。选育抗病品种是防治各类病害最为经济有效的手段，但目前生产上应用的水稻品种对RBSDV抗性较差，防治水稻黑条矮缩病主要使用农药杀灭传毒媒介灰飞虱来实现。但是，由于灰飞虱数量大、具有迁徙性及耐药性高等因素，往往导致防治效果不佳，且存在环境污染。因此，需加强RBSDV抗病品种的选育。

抗病资源的发掘与利用是RBSDV抗病品种的选育的基础。迄今为止，尚未发现对RBSDV免疫的品种/种质资源；已有的研究结果表明，RBSDV的抗性受多个数量性状位点控制，多个抗性基因/QTL聚合是抗黑条矮缩病水稻品种选育的重要途径。黑条矮缩病的发病规律以及发病地点较难掌控，田间鉴定缺少稳定性，靠人工接种病毒需大量的投入，造成水稻黑条矮缩病抗性鉴定较为困难，这限制了抗黑条矮缩病水稻品种的选育。因此，开展水稻黑条矮缩病抗性QTL定位及连锁标记开发对抗黑条矮缩病水稻品种的选育十分重要。

发明内容

本发明的目的是针对常规育种中水稻黑条矮缩病抗性鉴定稳定性、重复性较差及费时费力等缺点，提供了涉及水稻品系T1012(Dular为供体亲本，武育粳3号为轮回亲本的回交后代株系)中的抗黑条矮缩病位点鉴定及其分子标记方法，该方法可以预测被鉴定材料对水稻黑条矮缩病的抗性，简化了选择方法，进而加快抗病品种的育种进程。

为了实现上述发明目的，本发明采用的技术方案为：

本发明提供一种水稻黑条矮缩病抗性QTL qRBSDV-4位点，所述的qRBSDV-4位点与水稻第4染色体上物理位置为0.33Mb处的分子标记STS-4-3.1紧密连锁。

本发明还提供水稻黑条矮缩病抗性QTL qRBSDV-4位点的鉴定引物，所述的鉴定引物为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。

水稻黑条矮缩病抗性QTL qRBSDV-4位点的鉴定方法，其特征在于，用分子标记STS-4-3.1引物SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6分别扩增水稻抗黑条矮缩品种或育种材料以及T1012，当水稻抗黑条矮缩品种或育种材料扩增出与T1012同样的条带则标志着水稻抗黑条矮缩品种或育种材料带有抗黑条矮缩病位点qRBSDV-4。

T1012为一个用水稻抗条纹叶枯病亲本Dular与武育粳3号杂交，回交两代后连续自交构建的抗条纹叶枯病改良系。

水稻黑条矮缩病抗性QTL qRBSDV-4位点的鉴定方法，其特征在于，具体包含以下步骤：