[发明专利]一种高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36及其重组载体和表达方法在审
| 申请号: | 201910315071.3 | 申请日: | 2019-04-18 |
| 公开(公告)号: | CN109971770A | 公开(公告)日: | 2019-07-05 |
| 发明(设计)人: | 谢鑫;蒋君梅;任明见;李向阳;孙涛 | 申请(专利权)人: | 贵州大学;重庆出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
| 主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C07K14/415;C12N15/82;C12N15/66;A01H5/00;A01H6/46 |
| 代理公司: | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人: | 张行超 |
| 地址: | 550025 贵州省*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 高粱 基因 重组载体 抗病性 蛋白纯化系统 基因组数据库 原核表达载体 氨基酸序列 核苷酸序列 生物学特性 蛋白晶体 蛋白序列 基因构建 基因全长 同源基因 蛋白质 水稻 研究 | ||
本发明公开了一种高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明还公开一种高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36编码的蛋白质,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明还公开了包含上述高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36的重组载体和表达方法。本发明通过水稻ZFP基因的蛋白序列,从高粱基因组数据库中获得高粱同源基因SbZFP36,该基因全长711bp,并且根据该基因构建了原核表达载体,用蛋白纯化系统对其进行纯化,其结果为进一步研究蛋白晶体结构和生物学特性奠定基础,进而为通过基因编辑方法提高高粱的抗病性提供依据。
技术领域
本发明涉及一种高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36及其重组载体和表达方法,属于生物技术领域。
背景技术
高粱(Sorghum bicolor(L.)Moench),又名芦黍、芦栗,是一种重要的禾谷类作物,具有较强的抗逆境能力,也是饲料、酿酒、生产生物燃料、造纸以及工业淀粉的重要原料,同时也是近年来广泛使用的的一种畜牧饲用作物。高粱在我国的栽培历史悠久,在建国之前并未规模化栽培,直到上世纪70年代,随着经济和社会的发展,我国才逐渐重视并规模化栽培高粱。高粱属于短日照C4植物,相比其它的能源作物,高粱具有更加明显的光合作用效率以及更高的产量优势,因此,被誉为“高能作物”。近年来,随着全球性的环境问题和能源危机的日益严重,人们不断的再寻求一种安全、无污染、高效的生物质能源。其中高粱作为一种优质的能源植物引起科学界的重视和研究。为了更加深入研究高粱,美国能源部生物和环境研究中心于2009年顺利对高粱基因组进行测序并组装,这标志着对高粱的研究工作进入基因水平,同时也为高粱重要基因的克隆和功能分析提供了便利。
锌指蛋白是一类具有指状结构域的转录因子。根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)残基的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类。C2H2型锌指蛋白是最多也是研究最为清楚的一类锌指蛋白,在植物中已经克隆了50多个,主要涉及植物的生长发育和对环境胁迫的应答反应。但迄今为止,国内外尚未见到C2H2锌指蛋白在高粱中研究报道。
发明内容
针对现有技术的不足,本发明的目的是提供一种高粱C2H2锌指蛋白SbZFP36基因及其重组载体和表达方法。
本发明的技术方案是:一种高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36,其核苷酸序列如SEQID NO.1所示。
本发明还提供所述高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36编码的蛋白质,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
相应的,本发明提供包含上述高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36的重组载体和表达方法。
具体地,所述重组载体的制备方法如下:提取高粱RNA,并反转录出cDNA;以cDNA为模板扩增SbZFP36基因;将SbZFP36扩增产物经BamHI和EcoRI双酶切后,通过DNA连接酶插入到经同样双酶切的pET-28a表达载体中,得到重组质粒pET-28a-SbZFP36。
优选地,以cDNA为模板,利用以下引物扩增SbZFP36基因,引物序列如下:
上游引物:SbZFP36-F:GC
下游引物:SbZFP36-R:CG
上下游引物分别如SEQ ID NO.3、4所示。
具体地,表达高粱C2H2锌指蛋白基因SbZFP36的方法,包括以下步骤:
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