[发明专利]一种与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记及其用途有效
| 申请号: | 201910290920.4 | 申请日: | 2019-04-11 |
| 公开(公告)号: | CN109852710B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
| 发明(设计)人: | 游欣欣;许腾飞;阮志强;石琼;徐军民 | 申请(专利权)人: | 深圳华大海洋科技有限公司;深圳市华大海洋研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海尚象专利代理有限公司 31335 | 代理人: | 刘云 |
| 地址: | 518116 广东省深圳市大*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 石斑鱼 耐受 能力 相关 snp 标记 及其 用途 | ||
1.一种与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记,其特征在于,该SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.如权利要求1所述的与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记,其特征在于,所述的SNP标记用于进行石斑鱼分子标记辅助育种。
3.一种用于检测如权利要求1所述的与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记的引物,其特征在于,所述的引物是包含上游引物和下游引物的引物对;上游引物序列为:5’-CGATGTAATCCAACATTTCCTGA-3’,下游引物序列为:5’-GATTACAGGGGAAAAACTGCAGAGC-3’。
4.如权利要求3所述的用于检测与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记的引物,其特征在于,所述的引物,在使用时通过其将待测石斑鱼的与氨耐受能力相关的SNP标记所在的片段进行PCR扩增,再通过测序实现对所述SNP标记的检测,确定待测石斑鱼的所述SNP标记位点的基因型,从而确定待测石斑鱼的氨耐受能力。
5.如权利要求4所述的用于检测与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记的引物,其特征在于,所述的确定待测石斑鱼的所述SNP标记位点的基因型,是指确定所述SNP标记位点的碱基,从而确定待测石斑鱼的所述SNP标记位点的基因型为TT还是GT。
6.如权利要求5所述的用于检测与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记的引物,其特征在于,所述的SNP标记位点处的基因型为杂合GT的石斑鱼的氨耐受能力显著高于该处基因型为纯合TT的石斑鱼,从而确定待测石斑鱼的氨耐受能力。
7.一种用于检测与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒内包含如权利要求3所述的引物对;引物对中的上游引物序列为:5’-CGATGTAATCCAACATTTCCTGA-3’,下游引物序列为:5’-GATTACAGGGGAAAAACTGCAGAGC-3’。
8.一种如权利要求7所述的用于检测与石斑鱼氨耐受能力相关的SNP标记的试剂盒的用途,其特征在于,所述的试剂盒用于斜带石斑鱼选育,在使用时通过检测确定待测斜带石斑鱼的所述SNP标记的基因型,基于获得的基因型确定待测斜带石斑鱼的氨耐受能力,从而辅助斜带石斑鱼选育。
9.一种使用如权利要求8所述的试剂盒检测斜带石斑鱼氨耐受能力的方法,其特征在于,所述的方法是通过所述的试剂盒,对待测斜带石斑鱼进行PCR扩增、测序,检测确定待测斜带石斑鱼的所述SNP标记的基因型,进而基于获得的基因型确定待测斜带石斑鱼的氨耐受能力。
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