[发明专利]一种isomiR分子标志物的筛选方法及装置

说明书

本发明提供一种isomiR分子标志物的筛选方法，所述方法至少包括以下步骤：利用数据库，获取待检测疾病样本和对应健康样本的isomiR的表达数据；对所述待检测疾病样本和对应健康样本的isomiR的表达数据进行差异表达分析，得到以对应健康样本为对照，待检测疾病样本的isomiR的变化率；根据变化率选取isomiR；对选取的isomiR进行靶基因预测，获得靶基因；对所述靶基因进行功能分析，筛选与待检测疾病相关的靶基因，所述靶基因及其对应的isomiR即为所述待检测疾病的分子标志物。本发明所述方法分析流程思路清晰，其实现方法简单，可广泛应用于生物学研究工作中，也可用于临床相关应用。

技术领域

本发明涉及一种基因工程领域，特别是涉及一种isomiR分子标志物的筛选方法及装置。

背景技术

miRNA是生命活动的重要调节物质，原来通常认为，一个miRNA基因只能形成一种成熟的miRNA。然而，最近的研究发现，一个miRNA基因其实可以形成多种在长度或序列上存在差异miRNA异构体(isoforms of miRNA，isomiR)。

近几年来对isomiR呈爆发式增长的研究，研究表明很多isomiRs在癌症患者的血清或血浆中表达异常，可能作为抑癌基因或促癌基因参与肿瘤的发生发展，且其可以稳定的形态在体液中循环，在临床诊断中占据一定的优势。IsomiR的表达具有细胞及其组织特异性、疾病状态特异性，并具有参与细胞应激反应的能力。许多疾病的致病机制与isomiR或isomiR的表达变化相关，并可能成为疾病诊断的标记或治疗的靶标。isomiR序列可以结合靶mRNA，从而进一步发挥生物学作用。

近几年测序技术的广泛应用，为isomiR的发现和对它们功能的研究就提供了有利条件，可以针对其序列特点进行检测，并验证其表达模式和生物学功能提供数据基础。如何有效地对公共数据库的相关样本数据进行数据挖掘，筛选与疾病相关的isomiR分子标志物，是isomiR的一个应用难点。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点，本发明的目的在于提供一种isomiR分子标志物的筛选方法及装置。

为实现上述目的及其他相关目的，本发明第一方面提供一种isomiR分子标志物的筛选方法，所述方法至少包括以下步骤：

S1：利用数据库，获取待检测疾病样本和对应健康样本的isomiR的表达数据；

S2：对所述待检测疾病样本和对应健康样本的isomiR的表达数据进行差异表达分析，得到以对应健康样本为对照，待检测疾病样本的isomiR的变化率；

S3：根据变化率选取isomiR；

S4：对S3中选取的isomiR进行靶基因预测，获得靶基因；

S5：对所述靶基因进行功能分析，筛选与待检测疾病相关的靶基因，所述靶基因及其对应的isomiR即为所述待检测疾病的分子标志物。

本发明第二方面提供一种isomiR分子标志物的筛选装置，其特征在于，所述装置至少包括：

获取模块，用于利用数据库，获取待检测疾病样本和对应健康样本的isomiR的表达数据；

差异表达分析模块，用于对所述待检测疾病样本和对应健康样本的isomiR的表达数据进行差异表达分析，得到以对应健康样本为对照，待检测疾病样本的isomiR的变化率；

选取模块，用于根据变化率选取isomiR；

靶基因预测模块，用于对选取模块中选取的isomiR进行靶基因预测，获得靶基因；

功能分析模块，用于对所述靶基因进行功能分析，筛选出与待检测疾病相关的靶基因，所述靶基因及其对应的isomiR即为所述待检测疾病的分子标志物。