[发明专利]一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法在审
| 申请号: | 201910266011.7 | 申请日: | 2019-04-03 |
| 公开(公告)号: | CN110004239A | 公开(公告)日: | 2019-07-12 |
| 发明(设计)人: | 张文龙;顾金飞;李轶;牛丽华;张焕军;王龙飞 | 申请(专利权)人: | 河海大学 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/04;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 朱海琳;董建林 |
| 地址: | 210000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 微生物 溯源 潜在来源 点位 水体污染源 解析 采集 微生物分类 微生物数据 稳定性分析 应用可行性 测序分析 检测结果 结果判断 模型处理 重新采样 比对 数据库 分析 分类 检测 | ||
1.一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,包括以下步骤:
步骤1,根据水体污染物环境调查情况,对水体污染物类型与微生物溯源应用进行可行性分析;
步骤2,确定水体污染区域和潜在来源点位;
步骤3,采集水体污染区域和潜在来源点位样品;
步骤4,对采集样品进行DNA提取、PCR扩增以及测序分析,并基于微生物数据库进行微生物比对分类;
步骤5,基于步骤4所得微生物分类结果判断微生物溯源类型并处理相应的微生物数据;
步骤6,将步骤5处理后的数据,源和汇点位安排输入微生物溯源模型中进行检测;
步骤7,对微生物溯源模型处理结果进行稳定性分析,不符合要求的需重新采样分析;
步骤8,基于检测结果,根据判断方案判别水体污染区域的潜在来源。
2.根据权利要求1所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤3中所述样品包括水样,泥样,微生物膜,粪便或活性污泥。
3.根据权利要求1所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤4中基于Illumina Miseq平台进行高通量测序。
4.根据权利要求1所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤5中微生物溯源类型分为以下三类:
a.水体微生物污染溯源,直接通过选择合适引物进行扩增测序筛选出相关微生物数据,输入到微生物溯源模型中;
b.水体微生物功能基因溯源,将高通量测序得到的微生物数据进行功能基因分析或与相关基因库比对得到微生物功能基因数据,输入到微生物溯源模型中;
c.水体污染物相关指示微生物溯源,通过水体污染物与微生物的相关网络分析,筛选出与污染物有极大相关性的微生物数据,输入到微生物溯源模型中。
5.根据权利要求4所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤5中采用Spearman相关性分析进行数据处理。
6.根据权利要求1所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤6中微生物溯源模型采用SourceTracker。
7.根据权利要求1所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤7中稳定性分析采用重复多次检测结果的标准差SD和相对标准差RSD进行评估。
8.根据权利要求1所述的一种基于微生物溯源解析水体污染源的方法,其特征是,步骤8中判断方案为结合实际情况和潜在来源的贡献比例,判别水体污染区域的潜在来源。
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