[发明专利]基于云端的大型病理学图像协作注释方法及系统

说明书

本发明基于云端的大型病理学图像协作注释方法及系统，首先通过图像预处理模块，在云端通过超像素分割，对病理图片进行预先处理，同时以二值图像进行存储其边界；通过数据记录模块，进行多用户的数据记录，使用户可以协同标注图像；通过前端交互模块，完成对用户动作的捕获，以及病理图片的展示，通过后端处理模块，响应前端交互模块发来的请求，完成数据的标注以及对用户的可能标注区域的提示。通过以上模块所达到的效果，本发明完成在网页端对病理图片进行多人协作、像素级便捷标注的目的。

技术领域

本发明涉及数字化病理领域，具体为基于云端的大型病理学图像协作注释方法及系统。

背景技术

目前较为多数的数字化病理软件，主要针对已经标注完数据的病理图像进行展示与分析，缺少用户进行标注数据的软件。对于支持用户标注数据的软件，仅有以QuPath为典型代表的本地图像注释软件，以及以The Digital Slide Archive为代表的在线标注软件，但两者都有着各有优缺点。以QuPath为主的单机标注软件，可以在小区域进行超像素分割，并且用户可以进行选定区域，进行标注数据，然而其缺点也尤为明显，分别有以下四点：(1)若在不同电脑进行标注时，需要每台电脑各自安装配置软件，并且拷贝病理图片。通常软件与图片占据储存空间巨大，对电脑有较高要求，同时，需要专业人士进行安装调试。(2)导入图片之后需要软件进行对选定区域进行超像素分割。当选择较大区域或者全图进行超像素分割时，需要等待时间长。同时，每次超像素分割的结果不能保存，因此每次重启程序需要进行再次处理图片。(3)目前仅有单机版本，不支持多个用户进行同时标注，造成标注效率低下。(4)软件标注数据后的图片不具有机器可读性，仅可以用本身的软件进行打开，造成无法用其他软件进行分析标注的数据。以The Digital Slide Archive为代表的在线标注软件虽可以在线标注，但是除上文提到的第4点缺点外，同时功能较为单一，仅具有类似于涂鸦或者自定义多边形形状的标注，无法为用户进行准确便捷的标注。

发明内容

针对现有技术中存在的问题，本发明提供一种基于云端的大型病理学图像协作注释方法及系统，能够使得医疗图片进行便捷的像素级的云端标注，在用户标注数据前，预先进行处理图像，使其对用户使用的电脑配置要求不高，能够多用户位于一个服务器内进行标注数据，以及通过用户已经标注的数据，预测以及提示用户标注。

本发明是通过以下技术方案来实现：

基于云端的大型病理学图像协作注释方法，包括如下步骤，

图像预处理步骤；

在云端，通过并行处理对多张病理图片按照设定的子区域大小等级，进行超像素分割，得到多个子区域以及各个子区域平均像素个数所对应的子区域边界；

数据记录步骤；包括，

在云端，对图像预处理步骤得到的子区域和子区域边界进行记录和更新；

以及根据后端处理步骤中进行的增加或删除标记请求的处理结果，对请求的标记子区域进行一一对应的记录和更新；

后端处理步骤；

根据对数据记录步骤产生记录的查询；

以及根据前端交互步骤获取的图像处理请求、标记子区域请求、删除标记子区域请求和提示标注请求，分别对图像预处理步骤得到的子区域进行对应处理；

前端交互步骤；包括，

对后端处理步骤的处理结果的展示；

以及根据捕获的用户动作、对预览图片和标记子区域的操作，分别形成对应的图像处理请求、标记子区域请求、删除标记子区域请求和提示标注请求。

优选的，图像预处理的具体步骤包括如下，

步骤1.1，通过并行处理，读取多张病理图片，转换成可超像素分割处理格式图片；