[发明专利]一种与油菜角果数关联的分子标记引物及应用

说明书

本发明公开了一种与油菜角果数关联的分子标记及应用。本发明获得了一个与油菜角果数显著关联的SNP（单核苷酸多态性）标记，位于油菜A03染色体上第19,267,907个碱基位置，可解释7.6％的表型变异，根据该分子标记设计的引物为snpA03‑1F：ATTTTCATTGATAAACATACCGAATT，snpA03‑1R：TCAATTCATGCTGAAAATTAATGACTAT。利用该标记进行辅助选择可提高油菜高产育种效率。

技术领域

本发明属于分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及一种与油菜角果数关联的分子标记引物及应用。

背景技术

近年来，我国国产植物油自给率仅为35％左右，严重威胁着我国食用油供给安全(华玮等，2016)。油菜是我国第一大油料作物(Hu等，2016)，菜籽油是国产食用植物油的第一大来源。然而，与加拿大等菜籽出口国相比，我国油菜产业存在着产油量不高的问题，制约了其国际竞争力。在城镇化规模持续扩大耕地面积进一步缩小的形势下，持续提高单位面积产油量是主要出路。目前我国油菜品种含油量的提升相对较快(傅廷栋，2014)而单产仍然低于世界平均水平(http://apps.fas.usda.gov/psdonline/)且增加十分缓慢，这严重影响了农民种植油菜的经济效益和油菜产业的国际竞争力。因此，如何提高油菜单产是保证我国食用油安全的关键。

同一种植密度条件下，单位面积的油菜产量取决于单株产量，而单株产量由角果数、每角粒数和粒重三个产量构成因子决定。其中，角果数性状与产量相关性最高(Shi等，2015)。虽然油菜产量三个构成因子之间表现不同程度的负相关，但其相关系数往往不大(Shi等，2009)，这表明可以通过提高单个产量构成因子及聚合不同产量性状的优异位点来提高产量。

油菜角果数性状是典型的数量遗传性状，呈连续分布且易受环境影响。基于表型选择的常规育种方法对角果数的效果不好，育种效率较低。利用与角果数性状紧密连锁的分子标记可以弥补常规育种手段的不足，而且，可以聚合多个优异位点，大大提高育种效率。目前，油菜角果数性状的QTL定位有一些报道，但大部分位点不能重复，较难直接应用于油菜育种。Lu等利用关联群体在A01，A02，A03，A08，A09，A10，C04和C06染色体上检测到角果数关联位点，但均不能重复(Lu et al.,2018)；Ye等利用73290和中双11号构建的RIL群体，在A01，A02，A03，A04，A05，A06，A09，C02，C04和C06染色体上检测到15个角果数QTL，仅有4个可以重复检测到。

本发明利用331份材料构成的关联群体，对角果数进行多年多点考察，获得了在多个环境中均能检测到的角果数性状位点，并开发相应分子标记，用于油菜角果数性状的辅助选择。目前在A03染色体上第19,267,907个碱基位置附近未发现有与角果数相关的研究报道，这是一个新的控制油菜角果数性状的位点。

发明内容

本发明的目的是在于提供了检测油菜A03染色体上第19,267,907个核苷酸的试剂在油菜角果数筛选育种上的应用，所述的试剂包括引物。

为了达到上述目的，本发明采取以下技术措施：

与油菜角果数关联的分子标记的获得：

(1)收集331份来自世界各个国家的甘蓝型油菜自交系作为油菜核心关联群体，采集关联群体各株系的单株叶片，用CTAB法提取总DNA，利用油菜60K SNP芯片对每个样本进行基因型分析。