[发明专利]黑金红头鼠线粒体全基因组序列的扩增引物和扩增方法

说明书

一种黑金红头鼠线粒体基因组全序列扩增引物和扩增方法，是根据GenBank数据库中收录的黑躯兵鲶(Corydoras rabauti)线粒体全基因组序列设计22对扩增引物，以提取的黑金红头鼠基因组总DNA为模板，分别用该些扩增引物进行PCR扩增，扩增产物电泳后进行测序及序列拼接，获得黑金红头鼠线粒体基因组全序列，为观赏鱼类品种鉴定、资源保护提供了分子生物学信息。

技术领域

本发明涉及分子生物技术领域，特别涉及一种观赏性鱼类黑金红头鼠线粒体全基因组序列的扩增引物和扩增方法。

背景技术

黑金红头鼠，学名内格罗河兵鲶(Corydoras duplicareus)，隶属辐鳍鱼纲鲶形目美鲶科兵鲶属。原产地是巴西境内Nobua oba北方8公里处的Rio Poranga，是一种优良的观赏性鱼类。本种延续红头鼠群特有的淡雅体色，以及令人一眼即可看出特色差异的隐眼线与背部线条而极具观赏价值。成熟雌性拥有橄榄状的体型，不但腹部线条向左右两侧扩张，同时从侧面观察，更可见到雌鱼随生殖巢逐渐发育，而拥有足以撑起头部与尾端的便便大腹，最大体长在50-55mm之间。其喜好酸性软水，生性较敏感，所以饲养底层宜放置细软的河沙为主，同时在水流与光照控制上，需妥善搭配具有隐蔽性的造景素材，提供一个稳定安静的环境。目前国内引进大量鲶科鱼类作为观赏品种，但大多命名比较混乱，对物种的鉴定不准确。此外，现阶段对黑金红头鼠的研究非常少，特别是在分子生物学方面没有确切数据及分析。因此，对黑金红头鼠线粒体全基因组序列进行扩增和分析，可为鼠鱼的品种鉴定和资源保护提供科学依据。

发明内容

本发明所要解决技术问题是：针对上述现有技术的不足，提供一种观赏性鱼类黑金红头鼠线粒体全基因组序列的扩增引物和扩增方法，通过22对特异性引物对黑金红头鼠基因组进行PCR扩增，获得黑金红头鼠线粒体全基因组序列，为观赏鱼类品种鉴定、资源保护提供了分子生物学信息。

为解决述技术问题，本发明采用的技术方案是：一种黑金红头鼠线粒体基因组全序列的扩增引物，该扩增引物包括22对引物对：

第1对引物对的上游引物F1为：5’–CAGGCATCAGGCACAATCAT–3’，下游引物R1为：5’–CCGGTACACTTACCATGTTACGAC–3’；

第2对引物对的上游引物F2为：5’–GCACGAAGTGGGAAGAAATG–3’，下游引物R2为：5’–GGCCCACTGAAGCGGTAATC–3’；

第3对引物对的上游引物F3为：5’–GCTGGTTGCCTAAGAAGTGG–3’，下游引物R3为：5’–TGGTCGCCCCAACCGAAGAT–3’；

第4对引物对的上游引物F4为：5’–TGATCTGCCCGTGCAGAAGC–3’，下游引物R4为：5’–TGGGTGTGGCGAGAAATAGG–3’；

第5对引物对的上游引物F5为：5’–CGTAGTAGGCCCATTCGGAC–3’，下游引物R5为：5’–TTGGCATTCAGGCACAGCTC–3’；

第6对引物对的上游引物F6为：5’–CCTCGATTCCGCTACGACCA–3’，下游引物R6为：5’–CGAGGTGTGCAATTGATGAG–3’；

第7对引物对的上游引物F7为：5’–AGCCCCATTCGCACTAATCG–3’，下游引物R7为：5’–GCGGGGAAAGTAGATGAATG–3’；

第8对引物对的上游引物F8为：5’–TGAATGCAACCCAGACACTT–3’，下游引物R8为：5’–TAATTCCAGCGGCTAGGACT–3’；

第9对引物对的上游引物F9为：5’–CTCCATCTCGCTGGTGTTTC–3’，下游引物R9为：5’–TAGCGGCGAAGGCTTCTCAT–3’；