[发明专利]一种基于miRNA靶基因预测以及相关表达分析进行ceRNA预测的方法

权利要求书

1.一种基于miRNA靶基因预测以及表达相关性分析进行ceRNA预测的方法，其特征在于，包括如下步骤:

ceRNA作用对的相关性分析：

筛选于与lncRNA的皮尔逊相关系数高于0.7的RNA关系对；

根据共有MERs数量进行潜在ceRNA关系对筛选：

具有ceRNA关系的RNA对之间共有的miRNA数量符合负二项分布，进行超几何检验，筛选pvalue值小于0.05的显著性结果；

根据miRNA与ceRNA作用对三者之间的表达相关性，采用两种打分方式来评价miRNA对一对竞争的lncRNA-mRNA的调控功能：

i)调控相似性打分，miRNA与一对ceRNA两者之间的表达相关性，所述表达相关性范围在-1-1，绝对值大于0.7则为相关，绝对值越大相关性越高；之间的相似性越高，结果越可靠；

ii)敏感相关性打分，一对ceRNA之间的表达相关性与miRNA的介入的关联越高，结果越可靠，该分值大于0.3时，结果显著，分值越高越可靠；

获取统计检验显著的结果，并将结果按照打分进行排序；

所述敏感相关性打分如下：

计算RNA1和RNA2之间相关性，受它们共有的miRNA的影响程度，公式如下,corr(l,g)为RNA1和RNA2之间的相关性系数；

corr(m_k,l)为miRNA与RNA1的相关性系数，corr(m_k,g)为miRNA与RNA2的表达量相关性系数，M为RNA1和RNA2共有的miRNA数次；

筛选分值大于0.3的结果；

。

2.如权利要求1所述的一种基于miRNA靶基因预测以及表达相关性分析进行ceRNA预测的方法，其特征在于，所述的计算敏感相关性为：一对RNA之间的相关性，减去miRNA分别与所述一对RNA中的分别两条RNA的相关性，得到miRNA对两者的敏感性系数。