[发明专利]基因测序芯片及方法有效

专利信息
申请号: 201910154931.X 申请日: 2019-02-28
公开(公告)号: CN109837207B 公开(公告)日: 2020-09-15
发明(设计)人: 胡诗铭;节俊尧;刘文文;魏清泉;任鲁风;俞育德 申请(专利权)人: 中国科学院半导体研究所
主分类号: C12M1/34 分类号: C12M1/34;C12M1/00;C12Q1/6874
代理公司: 中科专利商标代理有限责任公司 11021 代理人: 周天宇
地址: 100083 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 基因 芯片 方法
【权利要求书】:

1.一种基因测序芯片,其特征在于,包括:

衬底(1);

第一光波导(2)、第二光波导(3)及金属针尖(5),都形成在所述衬底(1)上,三者呈T字形相对分布,所述第一光波导(2)与第二光波导(3)位置相对,其中,所述第一光波导(2)、第二光波导(3)为金属-介质-金属结构,第一光波导(2)及第二光波导(3)上制作有至少一个布拉格周期结构;

纳米孔(6),其设置在所述第一光波导(2)、第二光波导(3)与金属针尖(5)三者的接触区域,贯穿所述衬底(1);

所述第一光波导(2)及第二光波导(3)一端均为纵向三维渐变结构,所述第一光波导(2)及第二光波导(3)具有纵向三维渐变结构的一端相对;

所述第一光波导(2)与具有纵向三维渐变结构一端相对的另一端设有光源耦合器(7),所述第二光波导(3)与具有纵向三维渐变结构一端相对的另一端设有第一信号采集器(8)。

2.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述金属-介质-金属结构中金属的材料为具有强表面等离子体效应的金属。

3.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述第一光波导(2)及第二光波导(3)传输的激发光经所述纵向三维渐变结构压缩后,纵向尺寸小于10nm。

4.根据权利要求2所述的基因测序芯片,其特征在于,所述第一光波导(2)及第二光波导(3)传输的激发光波长范围为400nm~900nm。

5.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述金属针尖(5)为单层或多层具有平面针尖的金属层。

6.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述第一信号采集器(8)包括至少一个信号传输波导、至少一个微环滤波器、至少一个信号采集波导及至少一个光电探测器。

7.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述基因的单链碱基链的尺寸小于所述纳米孔(6)尺寸。

8.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述基因测序芯片还包括第三光波导(4)及第二采集器(9),其形成在所述衬底(1)上;

所述第三光波导(4)与所述T字形相对分布的第一光波导(2)、第二光波导(3)及金属针尖(5)构成十字形结构,所述第三光波导(4)具有纵向三维渐变结构一端与所述金属针尖(5)位置相对,所述第二采集器(9)位于所述第三光波导(4)与具有纵向三维渐变结构一端相对的另一端,所述第三光波导(4)为金属-介质-金属结构。

9.一种基于权利要求1-8任一项所述基因测序芯片的基因测序方法,其特征在于,包括:

S1,光源耦合器(7)产生的光信号的光场通过第一光波导(2)及第二光波导(3)进行压缩增强及谐振增强,形成激发光,其中,所述第一光波导(2)、第二光波导(3)为金属-介质-金属结构;

S2,控制待测基因的碱基链以单链的形式通过纳米孔(6),所述激发光激发所述碱基链产生拉曼信号;

S3,金属针尖(5)对所述拉曼信号进行针尖增强,并通过所述第一光波导(2)及第二光波导(3)进行谐振增强;

S4,第一信号采集器(8)采集经针尖增强与谐振增强后的拉曼信号,并与理论的碱基链拉曼信号数据对比,实现基因测序。

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