[发明专利]基因测序芯片及方法有效
| 申请号: | 201910154931.X | 申请日: | 2019-02-28 | 
| 公开(公告)号: | CN109837207B | 公开(公告)日: | 2020-09-15 | 
| 发明(设计)人: | 胡诗铭;节俊尧;刘文文;魏清泉;任鲁风;俞育德 | 申请(专利权)人: | 中国科学院半导体研究所 | 
| 主分类号: | C12M1/34 | 分类号: | C12M1/34;C12M1/00;C12Q1/6874 | 
| 代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 周天宇 | 
| 地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基因 芯片 方法 | ||
1.一种基因测序芯片,其特征在于,包括:
衬底(1);
第一光波导(2)、第二光波导(3)及金属针尖(5),都形成在所述衬底(1)上,三者呈T字形相对分布,所述第一光波导(2)与第二光波导(3)位置相对,其中,所述第一光波导(2)、第二光波导(3)为金属-介质-金属结构,第一光波导(2)及第二光波导(3)上制作有至少一个布拉格周期结构;
纳米孔(6),其设置在所述第一光波导(2)、第二光波导(3)与金属针尖(5)三者的接触区域,贯穿所述衬底(1);
所述第一光波导(2)及第二光波导(3)一端均为纵向三维渐变结构,所述第一光波导(2)及第二光波导(3)具有纵向三维渐变结构的一端相对;
所述第一光波导(2)与具有纵向三维渐变结构一端相对的另一端设有光源耦合器(7),所述第二光波导(3)与具有纵向三维渐变结构一端相对的另一端设有第一信号采集器(8)。
2.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述金属-介质-金属结构中金属的材料为具有强表面等离子体效应的金属。
3.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述第一光波导(2)及第二光波导(3)传输的激发光经所述纵向三维渐变结构压缩后,纵向尺寸小于10nm。
4.根据权利要求2所述的基因测序芯片,其特征在于,所述第一光波导(2)及第二光波导(3)传输的激发光波长范围为400nm~900nm。
5.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述金属针尖(5)为单层或多层具有平面针尖的金属层。
6.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述第一信号采集器(8)包括至少一个信号传输波导、至少一个微环滤波器、至少一个信号采集波导及至少一个光电探测器。
7.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述基因的单链碱基链的尺寸小于所述纳米孔(6)尺寸。
8.根据权利要求1所述的基因测序芯片,其特征在于,所述基因测序芯片还包括第三光波导(4)及第二采集器(9),其形成在所述衬底(1)上;
所述第三光波导(4)与所述T字形相对分布的第一光波导(2)、第二光波导(3)及金属针尖(5)构成十字形结构,所述第三光波导(4)具有纵向三维渐变结构一端与所述金属针尖(5)位置相对,所述第二采集器(9)位于所述第三光波导(4)与具有纵向三维渐变结构一端相对的另一端,所述第三光波导(4)为金属-介质-金属结构。
9.一种基于权利要求1-8任一项所述基因测序芯片的基因测序方法,其特征在于,包括:
S1,光源耦合器(7)产生的光信号的光场通过第一光波导(2)及第二光波导(3)进行压缩增强及谐振增强,形成激发光,其中,所述第一光波导(2)、第二光波导(3)为金属-介质-金属结构;
S2,控制待测基因的碱基链以单链的形式通过纳米孔(6),所述激发光激发所述碱基链产生拉曼信号;
S3,金属针尖(5)对所述拉曼信号进行针尖增强,并通过所述第一光波导(2)及第二光波导(3)进行谐振增强;
S4,第一信号采集器(8)采集经针尖增强与谐振增强后的拉曼信号,并与理论的碱基链拉曼信号数据对比,实现基因测序。
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