[发明专利]一种鉴定有效肿瘤新抗原的方法

权利要求书

1.一种鉴定有效肿瘤新抗原的方法，其特征在于，包括如下步骤：

（1）取肿瘤组织与正常组织样本，分别进行全基因组或外显子组测序，对比计算得到肿瘤组织的突变位置，截取以突变位置为中心的多肽片段，输入至人类MHC I 类的结合预测算法中，预测出各多肽片段与 MHC 亚型的亲和力，选出与MHC 亚型亲和能力高、包含肿瘤组织突变位置的多肽片段；所述截取以突变位置为中心的多肽片段为以突变位置为中心左右各 12 个残基的多肽片段；所述MHC I 类的结合预测算法为基于神经网络的 MHC-多肽亲和力预测；所述选出与MHC 亚型的预测亲和力为大于 0、小于等于 500 nM，包含肿瘤组织突变位置的多肽片段；

（2）将步骤（1）选出的多肽片段按照突变位置的功能分为三类：锚定位点突变类、非锚定位点 MHC 接触类和 TCR 接触类；

（3）进一步基于锚定位点突变类多肽的野生型氨基酸和突变型氨基酸进行分类，具体分为：非倾向性氨基酸突变为倾向性氨基酸类、非倾向性氨基酸突变为非倾向性氨基酸类、倾向性氨基酸突变为倾向性氨基酸类、和倾向性氨基酸突变为非倾向性氨基酸；所述分类的依据是多肽突变位置的 MHC 倾向性变化；

（4）挑选出所述多肽片段中 TCR 接触类、非锚定位点 MHC 接触类和锚定位点突变类中的非倾向性氨基酸突变为倾向性氨基酸作为新多肽群，所述新多肽群即为具有免疫原性潜力的肿瘤靶标。