[发明专利]一种流式细胞仪及超分辨率细胞图像的采集方法有效
申请号: | 201910151369.5 | 申请日: | 2019-02-28 |
公开(公告)号: | CN109870401B | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | 余宁梅;田典;方元 | 申请(专利权)人: | 西安理工大学 |
主分类号: | G01N15/14 | 分类号: | G01N15/14 |
代理公司: | 西安弘理专利事务所 61214 | 代理人: | 谈耀文 |
地址: | 710048*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 分辨率 图像 采集 方法 | ||
1.一种超分辨率细胞图像的采集方法,其特征在于,该方法应用一种流式细胞仪进行采集,所述一种流式细胞仪包括微流控芯片(1),所述微流控芯片(1)外围套有角度刻度盘(10),所述微流控芯片(1)下设置有两个相互平行的线阵探测器(2),所述微流控芯片(1)下表面与线阵探测器(2)上表面贴合,两个所述线阵探测器(2)均与数据处理装置(3)连接,所述数据处理装置(3)包括连接在一起的数据传输模块和数据处理模块,所述数据处理装置(3)为上位机PC,所述数据处理模块内设置有ASIC芯片,所述数据处理模块内设置有FPGA芯片;还包括有设置于微流控芯片(1)正上方的平行光源(5),所述平行光源(5)照射在微流控芯片(1)上形成平行光区,所述微流控芯片(1)内部设置有直线型的微通道a(4),所述微通道a(4)一端设置有样品入口(7),所述微通道a(4)另一端设置有样品出口(9),所述微通道a(4)与线阵探测器(2)之间形成夹角,且夹角θ满足如下关系:0°≤θ≤90°,所述微通道a(4)两侧均设置有微通道b(6),所述微通道b(6)一端设置有缓冲液入口(8),所述微通道b(6)另一端在靠近样品入口(7)处与微通道a(4)连通,具体包括以下步骤:
步骤1、向样品入口(7)通入样品,向缓冲液入口(8)通入缓冲液,样品与缓冲液在微通道a(4)中交汇形成层流并向样品出口(9)流动,两个线阵探测器(2)采集样品相同细胞具有时间差的细胞图像分别为Rp1和Rp2;
步骤2、以线阵探测器(2)的线阵方向为x轴、与线阵探测器(2)垂直方向为y轴建立平面直角坐标系,细胞的流动速度可沿x轴和y轴分解,根据两个线阵探测器(2)在y轴方向上的前后间距d和微通道a与线阵探测器(2)之间的夹角θ,计算两个线阵探测器(2)在细胞流动方向的距离d'如下,
d'=d/sinθ (11),
根据两个线阵探测器(2)在细胞流动方向的距离s,计算细胞的流动速度v如下,
v=d'·f/n (12),
式(12)中,n为细胞经过两个线阵探测器(2)的帧间隔数,f为每个线阵探测器(2)的帧频,由于n只能为不为0的自然数,其存在一定误差,当误差累计到1帧时,对其进行修正,修正帧间隔数为n'=n+γ,其中γ为修正因子,0≤γ<1,
将细胞的流动速度分别沿x轴和y轴分解,得到x轴的分解速度vx和y轴的分解速度vy如下,
vx=v·cosθ (13)
vy=v·sinθ (14),
x轴的分解速度vx是细胞在线阵探测器(2)采集的细胞图像上的横向速度,则细胞在线阵探测器(2)采集的细胞图像帧间的横向位移s为,
s=vx/f (15);
步骤3、根据横向位移s计算细胞在线阵探测器(2)采集的细胞图像帧间的修正横向位移s',分别将细胞图像Rp1和Rp2中的每帧图像进行反向位移、纵向拼接处理后最终得到细胞恢复图像R'p1、R'p2;
步骤4、通过插值放大算法分别对细胞恢复图像R'p1和R'p2进行缩放恢复出细胞超分辨率图像R”p1和R”p2;
步骤5、将细胞超分辨率图像R”p1和R”p2通过高反差保留算法或多帧超分辨率算法处理,再次提高图像分辨率、增强图像细节,最终得到超分辨率细胞图像,超分辨率细胞图像的采集完成。
2.根据权利要求1所述的一种超分辨率细胞图像的采集方法,其特征在于,所述步骤2、步骤3、步骤4和步骤5均由数据处理装置(3)实施。
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