[发明专利]circRNA及其在制备宫颈癌诊断试剂中的应用

说明书

本发明涉及circRNA及其在制备宫颈癌诊断试剂中的应用，具体涉及hsa_circ_0000069在制备宫颈癌诊断试剂中的应用。发明人对宫颈癌测序数据进行进一步挖掘和整合分析，用生物信息学方法构建circRNA‑miRNA‑mRNA相互作用的生物信息调控网络，寻找参与调控宫颈癌的关键分子hsa_circ_0000069和hsa‑miR‑125b‑5p，为宫颈癌的诊断提供了新的分子诊断标志物，为临床疾病基因检测提供研究基础。

技术领域

本发明属于肿瘤基因检测技术领域，具体涉及circRNA及其在制备宫颈癌诊断试剂中的应用。

背景技术

近年来，环状RNA(circular RNA，circRNA)成为继miRNA与1ncRNA后的又一非编码RNA研究热点，受到国内外学者的广泛关注。目前，circRNA的生物学功能研究仍处于探索阶段，已发现circRNA可作为竞争性内源RNA，即miRNA海绵，调节靶基因表达，还可作为转录调节子或RNA结合蛋白在转录后水平间接调控基因，在特定条件下circRNA甚至能够直接翻译蛋白。有研究表示ciRS-7在宫颈癌组织中表达水平明显高于正常宫颈组织，其调控的miR-7则在宫颈癌组织中低表达，显示在宫颈癌中ciRS-7负调控miR-7的表达，从而影响宫颈癌的发生和发展(ciRS-7/miR-7/FAK调节轴对宫颈癌侵袭迁移的影响及紫草素干预机制的研究，博士学位论文，2015)。ciRS-7的发现有助于了解circRNA在宫颈癌中的发生机制，同时也为筛选宫颈癌相关的新的合适的分子标志物提供研究方向。

宫颈癌是常见妇科肿瘤之一，在发展中国家己成为死亡率第二的恶性肿瘤。近年来随着HPV疫苗的广泛应用，宫颈癌己实现了一定程度的一级预防，其发病率与死亡率在许多发达国家明显下降，但较高的HPV感染率却伴随着相对较低的宫颈癌发病率，不但使宫颈癌的筛查及一级预防面临卫生经济学的沉重负担，也提示在宫颈癌发生发展过程中存在个体间遗传差异等其他重要因素。因此，深入探究宫颈癌的确切发病机制，并寻找新型诊断标志物与潜在治疗靶点至关重要。

高通量测序技术的广泛应用为疾病发病机理的研究提供了更加全面和快速的分析手段，发明人对宫颈癌测序数据进行进一步挖掘和整合分析，用生物信息学方法构建circRNA-miRNA-mRNA相互作用的生物信息调控网络，通过GeneCoDis3对生物信息网络中miRNA的靶基因以及circRNA的来源基因分别进行GO功能分析和Pathway分析，寻找参与调控宫颈癌的关键分子，发现了hsa_circ_0000069。郭等研究表明，hsa_circ_0000069与结直肠癌的增殖、侵袭等密切相关(Comprehensive profile of differentially expressedcircular RNAs revealsthat hsa_circ_0000069is upregulated and promotes cellproliferation,migration,andinvasion in colorectal cancer，Onco TargetsTher.2016；9:7451–7458)。但未有研究显示hsa_circ_0000069与宫颈癌是否相关，发明人还进一步分析得到与hsa_circ_0000069相互作用的hsa-miR-125b-5p，以及hsa-miR-125b-5p的靶基因，构建了hsa_circ_0000069生物信息调控网络。本申请为宫颈癌的诊断提供了新的分子诊断标志物，为临床疾病基因检测提供研究基础。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与宫颈鳞癌相关的circRNA，序列与SEQ ID NO.1具有90％以上序列同源性。

术语“同源”是主要是指序列上的同源，也就是用来说明两个或多个RNA或DNA序列具有相同的祖先。同源的序列一般有相似的功能。一般来说，当相似程度高于50％时，常推测检测序列和目标序列可能是同源序列；当相似性程度低于20％时，就难以确定其是否具有同源性。