[发明专利]一种基于叶绿体基因组序列的火炬松个体鉴定方法有效
申请号: | 201910049659.9 | 申请日: | 2019-01-18 |
公开(公告)号: | CN109609681B | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 黄少伟;刘天颐;蒋开彬;毛积鹏;何紫迪;陈杰湖;刘纯鑫 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 任重 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 叶绿体 基因组 序列 火炬松 个体 鉴定 方法 | ||
1.一种鉴定火炬松个体的种质或父系祖先的方法,其特征在于,检测待测样本的叶绿体基因组的分子标记,所述种质或父系祖先为“中国森林植物种质资源信息系统”中“种质中文名”为“火炬松武32”、“火炬松P043”、“火炬松P040”、“火炬松P051”、“火炬松W26”、“火炬松W16”、“火炬松W11”、“火炬松Q6”、“火炬松Q13”、“火炬松N3”、“火炬松G16”、“火炬松G10”、“火炬松G01”、“火炬松A279”、“火炬松A270”、“火炬松A262”、“火炬松A259”、“火炬松A201”、“火炬松24”、“火炬松18”或“火炬松13”中的一种或几种,所述分子标记为叶绿体基因组上的21个分子标记,所述21个分子标记为GenBank登录号NC_021440.1的序列上的第29448、29449、37238、37239、37240、39801、97585、100523、100730、100732、101076、101085、101103、101112、101121、101130、101139、101157、101166、104944和105020个碱基。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,按照GenBank登录号NC_021440.1的序列上的第29448、29449、37238、37239、37240、39801、97585、100523、100730、100732、101076、101085、101103、101112、101121、101130、101139、101157、101166、104944和105020个碱基的顺序,
以“火炬松武32”作为父系祖先的后代或“火炬松武32”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、T、A、G、T、T、T、T、T、T、G、T、T、G和T;
以“火炬松P043”作为父系祖先的后代或“火炬松P043”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、G、G、T、T、G和T;
以“火炬松P040”作为父系祖先的后代或“火炬松P040”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、T、T、T、T、G和T;
以“火炬松P051”作为父系祖先的后代或“火炬松P051”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、T、A、G、T、T、G、T、T、T、G、T、T、G和T;
以“火炬松W26”作为父系祖先的后代或“火炬松W26”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、G、T、T、T、G、T、G、G和T;
以“火炬松W16”作为父系祖先的后代或“火炬松W16”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、G、T、G、T、T、T、T、G和T;
以“火炬松W11”作为父系祖先的后代或“火炬松W11”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、G、G、A、G、T、T、T、T、T、T、T、T、T、A和T;
以“火炬松Q6”作为父系祖先的后代或“火炬松Q6”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、A、A、A、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、T、G、T、T、G和C;
以“火炬松Q13”作为父系祖先的后代或“火炬松Q13”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、G、T、T、T、G和T;
以“火炬松N3”作为父系祖先的后代或“火炬松N3”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、A、A、A、A、T、T、A、G、T、T、T、T、T、T、G、T、T、G和C;
以“火炬松G16”作为父系祖先的后代或“火炬松G16”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、A、A、A、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、T、G、T、T、G和T;
以“火炬松G10”作为父系祖先的后代或“火炬松G10”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、G、T、T、T、G、T、T、G和T;
以“火炬松G01”作为父系祖先的后代或“火炬松G01”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、T、G、T、T、T、T、T、G、T、G、T、T、G和T;
以“火炬松A279”作为父系祖先的后代或“火炬松A279”的21个分子标记的碱基依次为:G、T、T、T、T、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、T、T、T、T、A和T;
以“火炬松A270”作为父系祖先的后代或“火炬松A270”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、G、T、G、A、G、T、T、T、T、T、T、G、G、T、G和T;
以“火炬松A262”作为父系祖先的后代或“火炬松A262”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、A、A、A、A、T、G、A、G、T、T、T、T、T、T、T、G、T、G和C;
以“火炬松A259”作为父系祖先的后代或“火炬松A259”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、A、A、A、A、T、G、A、G、T、T、G、T、T、T、T、T、T、G和T;
以“火炬松A201”作为父系祖先的后代或“火炬松A201”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、G、T、T、G、T、T、T、T、G、T、T、G和T;
以“火炬松24”作为父系祖先的后代或“火炬松24”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、T、T、T、A、T、G、A、G、G、G、G、G、T、G、G、T、T、G和T;
以“火炬松18”作为父系祖先的后代或“火炬松18”的21个分子标记的碱基依次为:T、G、T、T、T、A、T、T、A、G、T、T、T、T、T、T、T、T、T、G和T;
以“火炬松13”作为父系祖先的后代或“火炬松13”的21个分子标记的碱基依次为:T、T、A、A、A、A、T、G、A、G、T、T、T、G、G、T、G、T、T、G和T;
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