[发明专利]一种检测尿嘧啶-DNA糖基化酶的生物传感器及其制备方法有效
| 申请号: | 201910022818.6 | 申请日: | 2019-01-10 |
| 公开(公告)号: | CN109752362B | 公开(公告)日: | 2021-06-15 |
| 发明(设计)人: | 王玉;李莎莎;刘素;黄加栋;张儒峰;赵一菡;瞿晓南;孙文玉;王业茹;张曼如 | 申请(专利权)人: | 济南大学 |
| 主分类号: | G01N21/65 | 分类号: | G01N21/65 |
| 代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 李桂存 |
| 地址: | 250022 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 嘧啶 dna 糖基化酶 生物 传感器 及其 制备 方法 | ||
本发明涉及生物传感器技术领域,特别涉及基于纳米金DNA分子机器与表面增强拉曼散射的生物传感器。为了解决以上现有技术中检测UDG活性的方法特异性和灵敏度都比较低、成本高的问题。一种基于DNA分子机器表面增强拉曼散射检测UDG活性的生物传感器,将纳米金分子机器与表面增强拉曼相结合,均相反应混合液。制备方法:合成金纳米粒子;将Hairpin Probe和Track DNA以及拉曼染料修饰到金纳米粒子表面;将标记的纳米金溶液与均相反应溶液混合。利用了内切酶IV的特异性切割实现DNA分子机器开启,利用表面增强拉曼检测实现了高灵敏性检测;利用外切酶Ⅲ,实现了DNA分子机器的循环,起到了信号放大的作用。
技术领域
本发明属于生物传感器技术领域,特别涉及基于DNA分子机器表面增强拉曼散射检测尿嘧啶-DNA糖基化酶活性的生物传感器,还涉及其制备方法。
背景技术
基因组由特定配对的DNA碱基组成,其稳定和准确性是所有生物体的先决条件。然而,DNA碱基的结构特性可能被多种环境因子和内源性活性氧物质破坏,导致基因组不稳定性和诱导癌变。尿嘧啶是DNA中常见的受损碱基,在DNA复制过程中dUTP错误掺入或胞嘧啶水解脱氨的结果,从而导致G:C碱基对转变成A:U碱基对,最终导致基因突变。通常通过碱基切除修复系统中的尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)来修复DNA内的尿嘧啶。尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)是一种高度保守的损伤修复酶,它可以通过催化尿嘧啶和DNA骨架之间的糖苷键的裂解来特异性地识别和切除尿嘧啶,释放受损的碱基并产生无碱基位点(AP位点),并最终与其他修复蛋白质协调以完成整个DNA修复。UDG在维持基因组完整性方面发挥着至关重要的作用,而UDG的异常表达与人类免疫缺陷,淋巴瘤,神经变性和癌症等多种疾病直接相关。因此,精确检测UDG活性对于生物医学研究和临床诊断至关重要。
传统的UDG活性检测方法有凝胶电泳法,核酸标记等方法,然而,它们需要复杂的核酸标记和凝胶电泳程序,并且耗时且灵敏度差,很难普遍化。为了克服以上缺陷,一些基于比色和荧光的UDG活性检测方法发展起来,这些新技术给UDG活性检测方面带来了巨大的进步;但要实现更加灵敏、特异性检测UDG还有待进一步改善。
发明内容
为了实现更加灵敏的、特异性的检测UDG活性,本申请提出了一种基于双酶辅助和DNA分子机器介导纳米金颗粒聚集检测DNA糖基化酶的生物传感器。
一种检测尿嘧啶-DNA糖基化酶的生物传感器,包括纳米金溶液、Hairpin Probe、Track DNA、拉曼染料、拉曼染料、均相反应液;
所述的Hairpin Probe、Track DNA序列为:
Hairpin Probe:
5’-SH-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGTATGTAGTAT
CTCTTTTTCUACATACTGTTTTTT-3’ 序列如SEQ No.1所示;
Track DNA: 5’-SH-TTTTGAGATACTACATAC-3’ 序列如SEQ No.2所示;
所述的DNA序列中,Hairpin Probe和Track DNA的5’端修饰-SH;
所述的Hairpin Probe序列5’第67位修饰U。
所述的均相反应液,包括内切酶IV、外切酶Ⅲ、待测物UDG、PBS。
所述的内切酶IV浓度为1 U/mL,所述的外切酶Ⅲ浓度为10U/mL,待测物UDG的浓度为1 U/mL。
所述的PBS为10mM Tris-HCL、50mM NaCl、10mM MgCl2、1mM DTT,pH=7.9。
上述生物传感器的制备方法,包括以下步骤:
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