[发明专利]一种乳杆菌特异性数据库及其应用在审
申请号: | 201910012202.0 | 申请日: | 2019-01-07 |
公开(公告)号: | CN109680082A | 公开(公告)日: | 2019-04-26 |
发明(设计)人: | 徐岩;吴群;杜如冰 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/06;C40B40/06;C12M1/34;C12M1/00 |
代理公司: | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人: | 张勇 |
地址: | 214000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳杆菌 特异性基因 引物 数据库 目的基因 荧光定量PCR检测 生物信息学领域 筛选 应用 应用范围广 准确度 快速锁定 生物领域 定量PCR 扩增 定性 验证 检测 分析 研究 | ||
1.一种乳杆菌特异性数据库,其特征在于,所述数据库中至少包括2种以上不同乳杆菌的
(i)特异性基因的序列;或者
(ii)特异性基因的NCBI登录号,或者其他基因或蛋白数据库登录号;或者
(iii)扩增特异性基因的引物序列。
2.根据权利要求1所述的乳杆菌特异性数据库,其特征在于,所述2种以上乳杆菌选自如下16种乳杆菌:Lactobacillus acetotolerans、Lactobacillus brevis、Lactobacillusbuchneri、Lactobacillus acidipiscis、Lactobacillus crustorum、Lactobacilluscurvatus、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillus diolivorans、Lactobacillusfermentum、Lactobacillus harbinensis、Lactobacillus hilgardii、Lactobacillusjohnsonii、Lactobacillus murinus、Lactobacillus panis、Lactobacillus plantarum、Lactobacillus reuteri。
3.根据权利要求1所述的乳杆菌特异性数据库,其特征在于,所述特异性基因的序列为NCBI上登录号如下所示的基因的序列中的一个或者多个。
4.一种定位乳杆菌特异性基因的装置或方法,其特征在于,包括存储权利要求1-3任一所述的乳杆菌特异性数据库的模块,或者可调取权利要求1-3任一所述的乳杆菌特异性数据库的模块。
5.根据权利要求4所述的装置或方法,其特征在于,所述装置或方法中,含有乳杆菌种类的选项;以及对应乳杆菌种类的特异性基因的序列、特异性基因的登录号或者扩增特异性基因的引物中的任意一种以上。
6.根据权利要求4所述的装置或方法,其特征在于,所述装置或方法,还包括登录模块。
7.根据权利要求4所述的装置或方法,其特征在于,还包括输入装置,用以输入乳杆菌的种信息;以及输出装置,用以输出所述乳杆菌的特异性基因信息或者可扩增特异性基因的引物。
8.一种定量或定性分析辅助乳杆菌的系统,其特征在于,包括存储权利要求1-3任一所述的乳杆菌特异性数据库的模块,或者可调取权利要求1-3任一所述的乳杆菌特异性数据库的模块。
9.根据权利要求8所述的系统,其特征在于,所述系统还包括如下装置中的任意一种或多种:引物设计装置、引物合成装置、PCR信息存储装置、PCR装置、基因组提取信息存储装置、用于基因组提取的试剂存储装置等。
10.一种定性或者定量乳杆菌的方法,其特征在于,所述方法包括利用乳杆菌的
(i)特异性基因的序列;或者
(ii)特异性基因的NCBI登录号,或者其他基因或蛋白数据库登录号;或者
(iii)扩增特异性基因的引物序列。
所述乳杆菌选自如下16种乳杆菌:Lactobacillus acetotolerans、Lactobacillusbrevis、Lactobacillus buchneri、Lactobacillus acidipiscis、Lactobacilluscrustorum、Lactobacillus curvatus、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillusdiolivorans、Lactobacillus fermentum、Lactobacillus harbinensis、Lactobacillushilgardii、Lactobacillus johnsonii、Lactobacillus murinus、Lactobacillus panis、Lactobacillus plantarum、Lactobacillus reute。
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