[发明专利]用于治疗眼病的预测性生物标记物

说明书

本发明涉及一种基于蛋白质组学变化来预测对眼病治疗的响应的方法。本发明还涉及用于该方法的试剂盒。

技术领域

本发明涉及蛋白质组学领域。更具体地，本发明涉及基于蛋白质组学变化来预测对眼病治疗的响应的装置和方法。

背景技术

泪膜和底下眼睛表面是眼睛的第一防线，并且眼泪在我们眼睛中具有数个目的；它们从眼睛上皮递送和取走营养物和代谢产物，它们润滑和保护上皮表面并且参与精细控制机制。泪液含有许多不同类型的分子，并且由于眼泪反映了底下眼睛表面的健康并且采集方法是非侵入性的，所以已经持续努力地用蛋白质组学分析眼泪以便鉴定对于各种疾病的潜在生物标记物。近年来，蛋白质组学已经用于各种眼病的研究中，包括干眼、糖尿病视网膜病和年龄相关的黄斑变性(AMD)。

蛋白质组学研究中常见的是合并样品以便获得对临床问题的更全面的回答，并且这种方式假设所有患者经历某些类似的蛋白质组学变化。这样，经常没有鉴定患者之间的个体差异。然而，药物试验已经证明患者对于相同治疗反应方式不同，并且潜在原因是复杂的并且仍然大多未知(GinsburyMcCarthy，2001；Schork，2015)。随着蛋白质组学领域的最新革新，主要是无标签质谱(MS)法，现在可以在大的临床研究中作为个体治疗每个患者，以便探索不同结果模式的潜在原因。

最近，眼泪蛋白质组学已经显示了其在鉴定关于与青光眼药物治疗相关的炎症响应的生物标记物中的潜力(Funke等，2016；Wong等，2011)。典型的药物治疗是目前最普遍的降低眼内压(IOP)的青光眼管理方法，并且因为病症是不可治愈的，所以患者经常需要数年或数十年使用滴眼液。先前的临床研究已经显示，长期使用局部青光眼药物治疗可诱发眼睛表面疾病的症状和体征，其在一定程度上和与干眼病相关的那些重叠。副作用不仅可以由滴眼液的活性化合物导致，而且可以由它们的防腐剂导致，所述防腐剂诸如苯扎氯铵(BAK)，苯扎氯铵在局部青光眼药物中以及在其他局部眼药中最著名的和最常用的防腐剂。临床证据提示，在使用防腐的局部治疗同时遭受副反应的患者受益于转换至不含防腐剂的滴眼剂：他们的副反应消失了，而不削弱IOP的控制。本发明基于青光眼药物治疗转换对于眼泪蛋白质组学的影响的研究，其采用更个人化的方法。药物试验已经证明，患者对于相同治疗反应方式不同，并且潜在原因是复杂的并且大多未知。因此，存在确定的对于这样的装置和方法的需要，所述装置和方法用于预测对于眼病治疗的个体化响应。

发明内容

本发明的一个目的是提供预测受试者对于眼病药物的响应的装置和方法，以及方法的不同应用。该目的是通过独立权利要求中所述的技术方案实现。本发明的优选实施方案在从属权利要求中公开。

更具体地，本发明提供了一种在需要眼病治疗的受试者中预测对眼病治疗的响应的方法，其中所述方法包括评估从所述受试者获得的样品中一种或多种生物标记物的水平，所述生物标记物包括PROL1，所述方法包括比较所述生物标记物的评估水平和对照，并且基于所述比较预测所述受试者对所述治疗的响应。

在该方法中，降低的PROL1水平表示所述受试者可能受益于所述治疗。在一些实施方案中，该方法包括评估获自所述受试者的样品的一种或多种另外的生物标记物的水平，所述另外的生物标记物选自由以下组成的组：TF、CST4、HSPA8、CST1、YWHAZ、RNH1、UCHL3、CST2、MYL6、S100A6、B2M、GSR、S100A8、HSPA5、YWHAE、CNDP2、CSTA、CSTB、CST5和CST3。优选的另外的生物标记物是TF和/或MYL6，以及CTS1或者没有CTS1。

本发明还提供了本发明方法的不同应用。该应用包括为患有眼病的受试者选择治疗方案，监视患有眼病的受试者对治疗的响应，基于对治疗的预测的响应将受试者分层(stratifying)，和将受试者分层用于临床试验。