[发明专利]表征与微生物相关联的女性生殖系统有关状况的方法和系统

权利要求书

1.一种用于表征与微生物相关联的至少一种女性生殖系统有关状况的方法，所述方法包括：

基于来自与受试者集合相关联的样品的微生物核酸，确定与所述受试者集合相关联的微生物序列数据集，其中所述样品包括与所述至少一种女性生殖系统有关状况相关联的至少一种样品；

针对所述受试者集合收集与所述至少一种女性生殖系统有关状况相关联的补充数据；

基于所述微生物序列数据集确定微生物组组成特征集合；

基于所述补充数据和所述微生物组组成特征集合，生成女性生殖系统有关表征模型，其中所述女性生殖系统有关表征模型与所述至少一种女性生殖系统有关状况相关联；

基于所述女性生殖系统有关表征模型，针对所述至少一种女性生殖系统有关状况为用户确定女性生殖系统有关表征；和

基于所述女性生殖系统有关表征，向所述用户提供疗法，以促进所述至少一种女性生殖系统有关状况的改进。

2.根据权利要求1所述的方法，

其中，所述至少一种女性生殖系统有关状况包括HPV感染；以及细菌性阴道病、宫颈炎、盆腔炎性疾病、特发性不孕症、有氧性阴道炎和不孕症中的至少一种，

其中所述微生物组组成特征集合包括与细菌靶标集合相关联的微生物组组成特征的第一子集、和与HPV靶标集合相关联的微生物组特征的第二子集，

其中所述细菌靶标集合包括以下至少一种：气球菌属(属)、克里斯滕森气球菌(种)、阿托波菌属(属)、阴道阿托波菌(种)、沙眼衣原体(种)、微需氧戴阿利斯特菌(种)、梭杆菌属(属)、具核梭杆菌(种)、加德纳菌属(属)、阴道加德纳菌(种)、孪生球菌属(属)、乳杆菌属(属)、惰性乳杆菌(种)、詹森氏乳杆菌(种)、巨球菌属(属)、动弯杆菌属(属)、克氏动弯杆菌(种)、羞怯动弯杆菌(种)、生殖支原体(种)、淋病奈瑟菌(种)、乳头状杆菌属(属)、微单胞菌属(属)、嗜胨菌属(属)、消化链球菌属(属)、卟啉单胞菌属(属)、普雷沃菌属(属)、阿门氏普雷沃菌(种)、蒂莫宁普雷沃菌(种)、斯尼西亚菌属(属)、金黄色葡萄球菌(种)、无乳链球菌(种)和苍白密螺旋体(种)，并且

其中，所述HPV靶标集合包括以下至少一种：HPV类型6、11、42、43、44、16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66和68。

3.根据权利要求1所述的方法，

其中所述补充数据针对来自所述受试者集合的受试者子集、指示缺少所述至少一种女性生殖系统有关状况，

其中确定所述微生物组特征集合包括基于所述微生物序列数据集，确定与所述受试者子集相关联的健康参考微生物组参数范围，并且

其中生成所述女性生殖系统有关表征模型包括，基于所述补充数据和所述健康参考微生物组参数范围，来生成所述女性生殖系统有关表征模型。