[发明专利]微生物组健康指数

说明书

公开了用于评估微生物群的方法。用于评估微生物群的示例方法可以包括从患者获取粪便样品；量化来自粪便样品中的选定的纲类组的细菌的相对丰度；根据来自选定的纲类组的细菌的相对丰度，计算微生物组健康指数，以及将微生物组健康指数与患者的身体状况相关联。

优先权要求

本申请根据35U.S.C.§119主张于2017年10月13日提交的美国临时专利申请No.62/571,907的优先权，其公开内容以引用方式全文并入于此。

技术领域

本发明涉及肠道微生物组。更具体地，本发明涉及平衡微生物组、治疗微生物组、通过检查微生物组来评估医学疾病和/或通过检查微生物组来评估医学治疗。

发明背景

多种医学疾病和/或身体状况可能与肠道微生物组有关。

发明内容

公开了一种用于评估微生物群的方法。该方法包含：获取粪便样品；以及量化来自粪便样品中的选定的纲类组的细菌相对丰度；根据来自选定的纲类组的细菌相对丰度，计算微生物组健康指数；以及考虑计算出的微生物组健康指数来评估粪便样品的微生物群。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，粪便样品可以来自一个人或来自多个人。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，选定的纲类组包括来自拟杆菌纲的细菌。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，选定的纲类组包括来自梭菌纲的细菌。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，选定的纲类组包括来自γ-变形菌纲的细菌。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，选定的纲类组包括来自芽孢杆菌纲的细菌。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，计算微生物组健康指数包括确定相对细菌丰度的第一总数，细菌丰度的第一总数等于细菌的第一纲类的第一相对丰度和细菌的第二纲类的第二相对丰度之和；确定相对细菌丰度的第二总数，细菌丰度的第二总数等于细菌的第三纲类的第三相对丰度与细菌的第四纲类的第四相对丰度之和；以及将相对细菌丰度的第一总数除以相对细菌丰度的第二总数。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，细菌的第一相对丰度是来自粪便样品中拟杆菌纲类的细菌相对丰度。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，细菌的第二相对丰度是来自粪便样品中梭菌纲类的细菌相对丰度。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，细菌的第三相对丰度是来自粪便样品中γ-变形菌纲类的细菌相对丰度。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，细菌的第四相对丰度是来自粪便样品中芽孢杆菌纲类的细菌相对丰度。

公开了一种用于评估治疗的方法。该方法包含：治疗患者的医学疾病；在治疗后从治疗后的患者那里获取粪便样品；根据来自治疗后粪便样品中选定的纲类组的细菌相对丰度，计算微生物组健康指数；以及考虑微生物组健康指数来评估治疗该患者医学疾病的效果。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，用于评估治疗的方法进一步包含量化来自粪便样品中的选定的纲类组的细菌相对丰度。

对于上述实施例中的任一个来说替代地或额外地，用于评估治疗的方法进一步包括在治疗之前从患者那里获取治疗前的粪便样品，并根据来自治疗前的粪便样品中选定的纲类组的细菌相对丰度，计算另一个微生物组健康指数。并且进一步地在一些实施方案中，该方法进一步包含将治疗前的粪便样品的微生物组健康指数与治疗后的粪便样品的微生物组健康指数进行比较以评估治疗的效果。