[发明专利]胞啃介导的表位发现

权利要求书

1.一种抗原鉴定的方法，所述方法包括以下步骤：

a)提供一种或更多种表达抗原特异性T细胞受体(TCR)的细胞群体；

b)提供一种或更多种靶细胞群体，其中所述靶细胞群体将一种或更多种抗原肽呈递在一种或更多种主要组织相容性复合体(MHC)等位基因上；

c)使所述一种或更多种表达抗原特异性TCR的细胞群体与所述一种或更多种靶细胞群体接触，其中所述接触包括提供足以用于所述一种或更多种表达抗原特异性TCR的细胞群体中的至少一种特异性结合所述一种或更多种靶细胞群体中的至少一种的条件，并且其中在结合之后，一种或更多种膜组分在至少一种表达抗原特异性TCR的细胞与至少一种靶细胞之间转移；

d)分离或已经分离

i)感兴趣的靶细胞，其中所述感兴趣的靶细胞包含在接触步骤(c)之后从所述至少一种表达抗原特异性TCR的细胞转移的所述一种或更多种膜组分，以及任选地

ii)感兴趣的表达TCR的细胞，其中所述感兴趣的表达TCR的细胞包含在接触步骤(c)之后从所述至少一种靶细胞转移的所述一种或更多种膜组分；并且

e)确定或已经确定

i)与所述感兴趣的靶细胞相关的一种或更多种抗原肽的序列，

ii)与所述感兴趣的表达TCR的细胞相关的TCR肽的TCR序列的至少一部分，或

iii)与所述感兴趣的靶细胞相关的一种或更多种抗原肽的序列以及与所述感兴趣的表达TCR的细胞相关的TCR肽的TCR序列的至少一部分。

2.一种抗原鉴定的方法，所述方法包括以下步骤：

a)提供表达抗原特异性TCR的抗原特异性T细胞群体；

b)提供多于一种靶细胞群体，其中所述靶细胞群体将抗原肽呈递在主要组织相容性复合体(MHC)等位基因上；

c)使所述抗原特异性T细胞群体与所述多于一种靶细胞群体接触，其中所述接触包括提供足以用于所述抗原特异性T细胞群体特异性结合所述多于一种靶细胞群体中的至少一种的条件，并且其中在结合之后，一种或更多种膜组分在抗原特异性T细胞与至少一种靶细胞之间转移；

d)分离或已经分离

i)感兴趣的靶细胞，其中所述感兴趣的靶细胞包含在接触步骤(c)之后从表达抗原特异性TCR的所述细胞转移的所述一种或更多种膜组分；以及

e)确定或已经确定与所述感兴趣的靶细胞相关的一种或更多种抗原肽的序列，

其中确定步骤(e)包括从所述感兴趣的靶细胞纯化一种或更多种多核苷酸或已经从所述感兴趣的靶细胞纯化一种或更多种多核苷酸，并且对纯化的多核苷酸或使用纯化的多核苷酸作为模板产生的任何多核苷酸进行测序或已经对纯化的多核苷酸或使用纯化的多核苷酸作为模板产生的任何多核苷酸进行测序。

3.一种抗原特异性TCR鉴定的方法，所述方法包括以下步骤：

a)提供一种或更多种表达抗原特异性TCR的细胞群体；

b)提供一种或更多种靶细胞群体，其中所述靶细胞群体将一种或更多种抗原肽呈递在一种或更多种主要组织相容性复合体(MHC)等位基因上；

c)使所述一种或更多种表达抗原特异性TCR的细胞群体与所述一种或更多种靶细胞群体接触，其中所述一种或更多种表达抗原特异性TCR的细胞群体中的至少一种特异性结合所述一种或更多种靶细胞群体中的至少一种，并且其中在结合之后，一种或更多种膜组分在至少一种表达抗原特异性TCR的细胞与至少一种靶细胞之间转移；

d)分离或已经分离

i)感兴趣的表达TCR的细胞，其中所述感兴趣的表达TCR的细胞包含在接触步骤(c)之后从所述至少一种靶细胞转移的所述一种或更多种膜组分，或者其中所述感兴趣的表达TCR的细胞显示出在接触步骤(c)之后从所述至少一种表达抗原特异性TCR的细胞转移的所述一种或更多种膜组分的丢失，以及任选地

ii)感兴趣的靶细胞，其中所述感兴趣的靶细胞包含在接触步骤(c)之后从所述至少一种表达抗原特异性TCR的细胞转移的所述一种或更多种膜组分；并且

e)确定或已经确定

i)与所述感兴趣的靶细胞相关的一种或更多种抗原肽的序列，

ii)编码与所述感兴趣的表达TCR的细胞相关的TCR肽的TCR序列的至少一部分，或

iii)与所述感兴趣的靶细胞相关的一种或更多种抗原肽的序列以及编码与所述感兴趣的表达TCR的细胞相关的TCR肽的TCR序列的至少一部分。