[发明专利]用于检测金黄色葡萄球菌的组合物和方法

权利要求书

1.一种组合物或试剂盒，其包括至少一种orfX扩增低聚物、至少第一SCCmec右端连接(MREJ)扩增低聚物和多种mec扩增低聚物，其中：

所述orfX扩增低聚物被配置成与包括SEQ ID NO:16的位置186或位置192中至少一个的位点特异性杂交；

所述MREJ扩增低聚物被配置成与SCCmec序列特异性杂交；

所述orfX扩增低聚物和所述MREJ扩增低聚物被配置成产生长度范围为约200个核苷酸到约2000个核苷酸的orfX/SCCmec连接扩增子；

所述多种mec扩增低聚物包括第一mecA/mecC扩增低聚物和第二mecA/mecC扩增低聚物；

所述第一mecA/mecC扩增低聚物被配置成与位点特异性杂交，所述位点包括：SEQ IDNO:13的位置1394和SEQ ID NO:14的位置1285，或SEQ ID NO:13的位置1484和SEQ ID NO:14的位置1376；

所述第二mecA/mecC扩增低聚物被配置成与包括SEQ ID NO:13的位置1312和SEQ IDNO:14的位置1203的位点特异性杂交；并且

所述第一mecA/mecC扩增低聚物和所述第二mecA/mecC扩增低聚物被配置成产生mec扩增子。

2.一种组合物或试剂盒，其包括至少一种orfX扩增低聚物、至少第一MREJ扩增低聚物以及至少第一GAPDH扩增低聚物和第二GAPDH扩增低聚物，其中：

所述orfX扩增低聚物被配置成与包括SEQ ID NO:16的位置186或位置192中至少一个的位点特异性杂交；

所述MREJ扩增低聚物被配置成与SCCmec序列特异性杂交；

所述orfX扩增低聚物和所述MREJ扩增低聚物被配置成产生长度范围为约200个核苷酸到约2000个核苷酸的orfX/SCCmec连接扩增子；

所述第一GAPDH扩增低聚物被配置成与包括SEQ ID NO:15的位置169或位置212的位点特异性杂交；

所述第二GAPDH扩增低聚物被配置成与包括SEQ ID NO:15的位置279、位置312或位置421的位点特异性杂交；并且

所述第一GAPDH扩增低聚物和所述第二GAPDH扩增低聚物被配置成产生GAPDH扩增子。

3.一种检测MRSA核酸的方法，其包括：

制备根据权利要求1或权利要求2所述的组合物，其中所述组合物进一步包括包含或怀疑包含MRSA核酸的样品；

使所述组合物经受扩增条件；以及

检测所述orfX/SCCmec连接扩增子以及所述mec扩增子和所述GAPDH扩增子中至少一种存在与否。

4.一种组合物或试剂盒，其包括：

orfX扩增低聚物，所述orfX扩增低聚物被配置成与包括SEQ ID NO:16的位置186或位置192中至少一个的位点特异性杂交；

至少一种检测低聚物，所述至少一种检测低聚物包括靶杂交序列，所述靶杂交序列被配置成与包括SEQ ID NO:16的位置201或位置210的位点特异性杂交；以及

至少第一MREJ扩增低聚物和第二MREJ扩增低聚物，其中：

所述orfX扩增低聚物和所述第一MREJ扩增低聚物被配置成从一种或多种第一MREJ类型的MRSA产生长度范围为约200个核苷酸到约2000个核苷酸的第一orfX/SCCmec连接扩增子；并且

所述orfX扩增低聚物和所述第二MREJ扩增低聚物被配置成从不同于所述一种或多种第一MREJ类型的一种或多种第二MREJ类型的MRSA产生长度范围为约200个核苷酸到约2000个核苷酸的第二orfX/SCCmec连接扩增子。

5.根据前述权利要求中任一项所述的组合物、试剂盒或方法，其中所述MREJ扩增低聚物被配置成与MREJ类型i、ii、iii、iv、v、vi、vii、viii、ix、xii、xiii、xiv、xv或xxi中至少一种的SCCmec序列特异性杂交。