[发明专利]包含细菌菌株的组合物

说明书

本发明提供了包含细菌菌株的组合物和所述组合物用于治疗疾病的用途。

技术领域

本发明属于包含细菌菌株的组合物和所述组合物用于治疗疾病的用途的领域。

背景技术

虽然认为人类肠道在子宫内是无菌的，但在出生后它立刻暴露于大量的母体和环境微生物。此后，出现微生物定殖和演替的动态期，其受例如分娩模式、环境、饮食和宿主基因型的因素影响，所有因素都影响肠微生物丛的组成，特别是在童年期间。随后，微生物丛稳定化且变成成人样[1]。人类肠微生物丛含有超过500-1000个不同种系型，所述种系型基本上属于两大细菌分类-脆弱拟杆菌(Bacteroidete)和厚壁门菌(Firmicute)[2]。由人类肠的细菌定殖产生的成功共生关系产生多种代谢、结构、保护和其它有益的功能。定殖肠部的增强的代谢活性确保降解以其它方式无法摄取的饮食组分，同时释放副产物，为宿主提供重要的营养物来源。类似地，充分认识到肠微生物丛的免疫重要性，并且在免疫系统减弱的无菌动物中例示，所述动物的免疫系统在引入共生细菌后在功能上复原[3-5]。

已经在例如炎性肠病(IBD)的胃肠道病症中证明微生物丛组成的显著变化。举例来说，在IBD患者中梭状芽孢杆菌属(Clostridium)XIVa簇细菌的水平降低，而大肠杆菌的数目增加，这表明在肠内共生体与病原性共生体的平衡发生变化[6-9]。有趣的是，与IBD炎性状态相关的所述微生物改变的特征在于效应T细胞群体的不平衡。

与微生物丛改变有关的许多人类疾病的标志是微生物丛多样性的损失，这与所谓的菌群失调不同，菌群失调仅仅是与健康受试者中的典型聚集微生物丛相比，微生物丛组成有所改变。肠微生物丛的多样性的变化已经引起了显现癌症的风险的调节[10]。重建健康微生物丛是困难的，因为肠道中的细菌抵抗定殖。这在设法通过增加微生物丛的多样性来治疗不健康受试者的微生物丛时提出挑战[11]。但是，尚未充分了解微生物丛多样性与癌症之间的联系。

本领域中需要治疗疾病的新方法，所述新方法得益于微生物丛多样性的增加和/或微生物丛多样性的稳定性的增加。

发明内容

本发明人已经研发出通过增加和/或稳定受试者中的肠微生物丛多样性来治疗和/或预防疾病的新疗法。具体地说，本发明人已经发现来自肠球菌属(Enterococcus)的细菌菌株可以有效地增加和/或稳定受试者的远端肠道中的肠微生物丛多样性。本发明人已经确定选自由鹑鸡肠球菌(Enterococcus gallinarum)和铅黄肠球菌(Enterococcuscaselliflavus)组成的清单的物种的细菌菌株能够尤其有效地增加和/或稳定受试者，尤其是经诊断患有疾病的受试者中的微生物丛多样性。

本发明提供了一种包含肠球菌属的细菌菌株的组合物，所述组合物用于增加和/或稳定受试者中的微生物丛多样性的方法中。类似地，本发明还提供了一种增加和/或稳定受试者中的微生物丛多样性的方法，其中所述方法包括向受试者施用包含肠球菌属的细菌菌株的组合物的步骤。优选地，肠球菌属为鹑鸡肠球菌或铅黄肠球菌物种的细菌菌株。

表述“增加微生物丛多样性”在本文中用于意指增加受试者的微生物丛中的不同细菌类型的数目和/或不同细菌类型的均衡。微生物丛多样性可以通过受试者中的细菌的不同种属、物种或菌株的数目增加来测量。此微生物丛多样性的增加可以在受试者的肠部或受试者的远端肠道中。增加或均衡可以相对于在施用根据本发明的组合物前受试者中的多样性/均衡来测量。在用本发明的组合物治疗后微生物丛中的不同细菌类型的相对丰度变得更加均衡。

“稳定微生物丛多样性”意指微生物丛中的不同种属的相对数目保持稳定(例如在两次测量之间相对数目波动至多70％、80％、90％、95％或99％)。微生物丛多样性的稳定可以在受试者的肠部或受试者的远端肠道中。相对稳定性可以相对于在施用根据本发明的组合物前的稳定性评定。