[发明专利]分子库制备方法以及其组合物和用途在审
申请号: | 201880050920.0 | 申请日: | 2018-06-29 |
公开(公告)号: | CN111108215A | 公开(公告)日: | 2020-05-05 |
发明(设计)人: | M·安德森;D·马祖尔 | 申请(专利权)人: | 生命技术公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6853 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 李程达 |
地址: | 美国加*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 制备 方法 及其 组合 用途 | ||
1.一种用于制备目标核酸序列的分子库的方法,其包含:
(a)使核酸样品与多个衔接子接触,所述衔接子能够在其中所述目标核酸经历第一扩增的条件下扩增所述样品中的一个或多个目标核酸序列;
(b)消化所得第一扩增产物以减少或消除所得引物二聚体并制备经部分消化的目标扩增子,从而产生有间隙的双链扩增子,并进而修复所述经部分消化的目标扩增子;以及
(c)使用通用引物在第二扩增中扩增所述经修复的目标扩增子,
由此产生目标核酸序列的分子库;
其中,所述多个衔接子中的每一个均包含通用固定结构序列和目标核酸序列和可裂解部分以及任选的一个或多个标签序列;并且其中包括至少两个且最多十万个目标特异性衔接子对,
其中,所述衔接子的目标核酸序列包括至少一个可裂解部分并且所述通用固定结构序列不包括所述可裂解部分。
2.根据权利要求1所述的方法,其中至少一个衔接子中包括任选的标签序列,并且所述衔接子序列中包括侧接所述标签序列的任一个末端的可裂解部分。
3.根据权利要求1所述的方法,其中每个通用序列的熔融温度高于所存在的每个目标核酸序列和每个标签序列的熔融温度。
4.根据权利要求1所述的方法,其在单一、仅添加型工作流程反应中进行,可实现高度多重化的目标分子库的快速产生。
5.根据权利要求2所述的方法,其中所有所述衔接子包含带有侧接所述标签序列的任一个末端的可裂解基团的标签序列。
6.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中步骤(b)的消化和修复是在单一步骤中进行的。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述步骤(b)的消化和修复是在不同温度下,以短暂分开的方式进行的。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述方法的一个或多个步骤是以手动模式或自动模式或其组合进行的。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述方法的每个步骤是以自动模式进行。
10.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其进一步包含至少一个纯化步骤。
11.根据权利要求10所述的方法,其中纯化步骤仅在步骤(c)之后进行。
12.根据权利要求10所述的方法,其中第一纯化步骤在步骤(b)之后进行并且第二纯化步骤在步骤(c)之后进行。
13.根据权利要求10所述的方法,其中分子库由步骤(a)的所述第一扩增产生的衔接子-二聚体副产物从所得分子库中去除。
14.根据权利要求10所述的方法,其中扩增后所得的目标核酸的富集体含有数量减少的衔接子-二聚体副产物。
15.根据权利要求14所述的方法,其中衔接子-二聚体副产物全部被消除。
16.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述能够扩增一个或多个目标核酸序列的多个衔接子包含能够扩增至少两个不同目标核酸序列的多个衔接子对。
17.根据权利要求2所述的方法,其中所述多个衔接子的每个目标特异性对可包括高达16,777,216个包含不同标签序列的不同衔接子组合。
18.根据权利要求17所述的方法,其中每个所产生的目标特异性扩增子序列包括至少1个不同序列且可高达107个不同序列。
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