[发明专利]合成群体调节裂解

权利要求书

1.通过群体感应来维持共培养物的方法，该方法包括：

将至少第一细菌菌株和第二细菌菌株共培养至少12小时的时间；其中：

第一和第二细菌菌株中的至少一种相比于至少一种其它细菌菌株具有生长优势；并且

所述第一和第二细菌菌株各自包含：

裂解质粒，其具有由可激活启动子控制的裂解基因；以及

激活子质粒，其具有激活子基因，该激活子基因的表达促进群体感应分子的积累；

其中所述裂解基因的可激活启动子和所述激活子基因的表达均由所述群体感应分子激活；

其中第一菌株的群体感应分子与第二菌株的群体感应分子不同；并且

其中第一和第二菌株的群体感应分子各自对于另一菌株的裂解基因的可激活启动子没有影响或基本没有影响。

2.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一和第二菌株中的至少一种的裂解质粒和激活子质粒是同一质粒。

3.如权利要求1-2中任一项所述的方法，其中，所述第一和第二菌株中的至少一种的裂解质粒和激活子质粒是不同质粒。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中，至少所述第一和第二菌株存在代谢竞争。

5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，其中，至少所述第一和第二菌株选自大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌或其细菌变体。

6.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中，所述第一菌株相比于所述第二细菌菌株不具有生长优势。

7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，其中，在所述第一和第二菌株的各菌株中，所述裂解质粒包含裂解基因、可激活启动子和任选的报告基因；并且所述激活子质粒包含激活子基因、降解标签和任选的报告基因。

8.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其中，所述第一和第二菌株中的至少一种中的所述裂解基因是来自噬菌体ΦX174的E。

9.如权利要求1-8中任一项所述的方法，其中，在所述第一菌株中，所述可激活启动子是LuxR-AHL可激活luxI启动子，并且所述激活子基因是LuxI。

10.如权利要求1-9中任一项所述的方法，其中，在所述第二菌株中，所述可激活启动子是RpaR-AHL可激活RpaI启动子，并且所述激活子基因是RpaI。

11.如权利要求7所述的方法，其中，至少一个报告基因选自编码绿色荧光蛋白GFP、青色荧光蛋白CFP、红色荧光蛋白RFP或其变体的基因。

12.如权利要求7所述的方法，其中，所述降解标签是ssrA-LAA降解标签。

13.如权利要求1-12中任一项所述的方法，其中，以1:100的比例接种所述共培养物，所述比例是相比于另一种细菌菌株具有生长优势的细菌菌株的比例。

14.如权利要求1-13中任一项所述的方法，其中，所述质粒中的至少一种整合到所述第一和第二菌株中的至少一种的基因组中。

15.如权利要求1-14中任一项所述的方法，其中，所述质粒中的至少一种还包含质粒稳定元件。

16.如权利要求15所述的方法，其中，所述质粒稳定元件是毒素/抗毒素系统或肌动蛋白样蛋白质分配系统。

17.如权利要求1-16中任一项所述的方法，其中，所述培养在微流体装置中进行。

18.如权利要求1-17中任一项所述的方法，其中，所述一段时间是12至72小时。