[发明专利]个体和队列药理学表型预测平台在审
申请号: | 201880046200.7 | 申请日: | 2018-05-11 |
公开(公告)号: | CN111742370A | 公开(公告)日: | 2020-10-02 |
发明(设计)人: | B.D.阿西;A.阿林-富伊尔;G.A.希金斯;J.S.伯恩斯;A.卡利宁;B.保尔斯;A.阿德;N.里马鲁恩 | 申请(专利权)人: | 密歇根大学董事会 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B40/00 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 张凌苗;申屠伟进 |
地址: | 美国密*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 个体 队列 药理学 表型 预测 平台 | ||
1.一种用于使用统计建模和机器学习技术来鉴定药理学表型的计算机实施的方法,所述方法由一个或多个被编程为执行所述方法的处理器执行,所述方法包括:
在一个或多个处理器处获取一组训练数据,所述训练数据包含多个第一患者中的每一个患者的以下数据:
组学数据,其指示所述第一患者的生物学特征,
社会组学数据,其指示与不良文化、童年时期、急性或慢性创伤事件或因不利条件造成的慢性应激相关联的危险因素,
环境学数据,其指示随时间推移收集的所述第一患者的经历,以及
表型组学数据,其指示以下至少一项:对一种或多种药物的反应、所述第一患者是否经历药物滥用或所述第一患者的一种或多种慢性疾病;
通过所述一个或多个处理器生成统计模型,所述统计模型用于基于所述一组训练数据确定药理学表型;
在所述一个或多个处理器处接收在一段时间内收集的第二患者的一组组学数据以及社会组学和环境学数据;
通过所述一个或多个处理器将所述第二患者的所述组学数据以及所述社会组学和环境学数据应用于所述统计模型,以确定所述第二患者的一种或多种药理学表型;以及
通过所述一个或多个处理器提供所述第二患者的所述一种或多种药理学表型以展示给医疗保健提供者,其中所述医疗保健提供者根据所述药理学表型向所述第二患者推荐治疗方案。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述社会组学和环境学数据指示随时间推移收集的所述第一患者的经历,其包含以下至少一项:临床数据,所述临床数据指示所述第一患者的病史;所述第一患者的人口统计学数据;所述第一患者的社会经济学数据;或多药房数据,所述多药房数据指示从至少两个时间实例收集的以处方形式开具给所述第一患者的每种药物。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中所述第二患者的所述一种或多种药理学表型包含以下至少一项:所述第二患者对一种或多种药物的预测反应、一种或多种疾病的风险、对所述一种或多种药物的不良药物事件或不良药物反应或药物滥用的可能性。
4.根据权利要求1到3中任一项所述的方法,其中所述一种或多种药理学表型包含所述第二患者对一种或多种药物的预测反应,并且所述方法进一步包括:
在所述一个或多个处理器处接收对于所述第二患者诊断出的疾病类型的指示;
通过所述一个或多个处理器将所述第二患者的所述组学数据以及所述社会组学和环境学数据应用于所述统计模型,以确定所述第二患者对用于治疗对于所述第二患者诊断出的所述疾病类型的多种药物的预测反应;
基于所述多种处方药物中的每一种药物的所述预测反应,通过所述一个或多个处理器鉴定用于治疗所述第二患者的多种药物中的一种药物;以及
通过所述一个或多个处理器向所述医疗保健提供者提供已鉴定药物的指示,以便针对对于所述第二患者诊断出的所述疾病类型制定最佳治疗方案的处方。
5.根据权利要求4所述的方法,其中基于所述预测反应鉴定用于治疗所述第二患者的所述多种药物中的一种药物包含:
对于所述多种药物中的每一种药物:
基于所述第二患者的所述组学数据以及所述社会组学和环境学数据,通过所述一个或多个处理器确定所述药物对于所述第二患者的疗效;
基于所述第二患者的所述组学数据以及所述社会组学和环境学数据,通过所述一个或多个处理器确定关于所述第二患者的一种或多种预期的不良药物反应;
通过所述一个或多个处理器结合所述疗效和所述一种或多种预期的不良药物反应来确定所述药物对所述第二患者的总体价值;以及
通过所述一个或多个处理器鉴定所述多种药物中对所述第二患者的总体价值最高的药物。
6.根据权利要求1到5中任一项所述的方法,其中所述一种或多种药理学表型包含药物滥用的可能性,并且所述方法进一步包括:
通过所述一个或多个处理器将所述第二患者的所述组学数据以及所述社会组学和环境学数据应用于所述统计模型,以确定所述第二患者滥用药物的可能性超过阈值可能性;以及
通过所述一个或多个处理器提供所述第二患者预期会出现药物滥用问题的指示,以展示给医疗保健提供者从而进行早期干预。
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