[发明专利]丙型肝炎病毒(HCV)的测定在审
申请号: | 201880043313.1 | 申请日: | 2018-10-03 |
公开(公告)号: | CN110892082A | 公开(公告)日: | 2020-03-17 |
发明(设计)人: | D·吐尔西;S·黄;H·苏;D·德拉普;W·卡米尼蒂;K·诺丁;S·阿尔斯兰;S·琼斯 | 申请(专利权)人: | 雅培分子公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70 |
代理公司: | 北京市中伦律师事务所 11410 | 代理人: | 酒向飞 |
地址: | 美国伊*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肝炎 病毒 hcv 测定 | ||
1.用于扩增和检测样品中的人丙型肝炎病毒(HCV)核酸序列的寡核苷酸序列的组,其包含:
(a)正向引物寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:5;
(b)反向引物寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:8或SEQ ID NO:9;
(c)第一探针寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11或SEQID NO:12;以及
(d)第二探针寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:14,其中所述第一和第二探针寡核苷酸序列各自包含可检测标记。
2.根据权利要求1所述的组,进一步包括:
(e)内置对照正向引物寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:15,
(f)内置对照反向引物寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:16,以及
(g)内置对照探针寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:17和可检测标记。
3.根据权利要求1或2所述的组,其中:
(a)所述正向引物寡核苷酸序列包含SEQ ID NO:1;
(b)所述反向引物寡核苷酸序列包含SEQ ID NO:2;
(c)所述第一探针寡核苷酸序列包含SEQ ID NO:3;并且
(d)所述第二探针寡核苷酸序列包含SEQ ID NO:4。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的组,其中所述可检测标记是荧光团。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的组,其中每个探针寡核苷酸还包含淬灭剂部分。
6.一种在疑似含有丙型肝炎病毒的样品中检测人丙型肝炎病毒的方法,所述方法包括:
(a)使从人获得的样品与根据权利要求1-5中任一项所述的寡核苷酸序列的组和用于扩增和检测核酸序列的试剂接触,
(b)扩增所述样品中存在的第一靶标HCV核酸序列,
(c)使第一和第二寡核苷酸探针与所述第一靶标HCV核酸序列杂交,
(d)通过评估来自每个所述可检测标记的信号,检测所述第一和第二探针寡核苷酸序列与所述第一靶标HCV核酸序列的杂交,由此
(i)存在所述信号表示所述第一和第二探针寡核苷酸序列与所述第一靶标HCV核酸序列的杂交以及在所述样品中存在HCV,并且
(ii)缺少所述信号表示在所述样品中不存在HCV。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述第一靶标HCV核酸序列包含HCV基因组的5′非翻译区(UTR)的至少一部分。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其进一步包括使所述样品与扩增和检测第二靶标HCV核酸序列的引物和探针组接触。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述第二靶标HCV核酸序列包含HCV基因组的3′非翻译区(UTR)的至少一部分。
10.根据权利要求8或9所述的方法,其中,所述引物和探针组包括:
(a)正向引物寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:18;
(b)反向引物寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:19;以及
(c)探针寡核苷酸序列,其包含SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:21以及可检测标记。
11.根据权利要求6-10中任一项所述的方法,其中所述样品包括血液、血清、血浆、唾液、尿液、阴道液或精液。
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