[发明专利]基于胃癌生物学特征的集群分类及预后预测系统

说明书

本发明涉及基于胃癌生物学特性的集群分类和预后预测系统，其中开发了利用靶基因集群的mRNA表达水平的定量值在存活率方面预测进展期胃癌患者预后的算法，并且该算法可以用作确定胃癌患者治疗方法的辅助信息。

技术领域

本发明涉及一种基于胃癌生物学特征的组分类及预后预测系统。

背景技术

在全球范围内，胃癌是所有癌症中死亡率第三高的癌症，尤其在韩国，胃癌是除了甲状腺癌外最常见的癌症，而众所周知甲状腺癌预后较好。在韩国，由于国家健康检查的早期检测、手术标准化和抗癌药物的发现等已经使胃癌患者的存活率增加。然而，尽管目前有标准化的治疗，仍有大约一半的II期和III期进展期胃癌患者会复发。

癌症已被认为是基因疾病，随着基因检测技术例如下一代测序(NGS)的发展，人们不再根据现有的解剖学表型和病理学表型对癌症进行分类，而是根据分子生物学特性对癌症进行分类。最近报道，在癌症基因组图谱(TCGA)项目中，胃癌可根据其不同的分子特征而大致分为四种类型。这表明，即使在解剖学意义上的临床分期相同，预后和化疗的获益程度也可能因分子生物学特征而不同。

根据近期报道的TCGA项目中295例胃癌患者的结果，胃癌可分为四类：①爱泼斯坦-巴尔病毒阳性(Epstein-Barr virus positive，EBV阳性)胃癌；②微卫星高度不稳定性(MSI-H)胃癌；③染色体不稳定性(CIN)胃癌；④基因稳定性(GS)胃癌。通过这种大规模的癌症基因组测序，可以看到胃癌被划分为分子遗传学上不同的异质性亚组，而不是单一类型的癌症。因此，为了实现胃癌的个体化治疗，有必要根据分子遗传学和病理学特征来识别亚类，发现并应用相应的靶基因。此外，在胃癌研究中，已经报道了可以根据胃癌的亚型对胃癌的预后进行分类的结果。

如果能够预测患者在胃癌术后进行抗癌药物治疗后的预后，那么这将是能够确定适合每种预后的治疗策略的证据数据。目前，在标准化的治疗实践中，所有II期和III期的进展期胃癌患者均采用术后辅助抗癌疗法治疗。然而，对预后不良的组可能治疗不足。因此，如果能够展开除目前的标准治疗以外的其他治疗方法的策略，那么可能对于预后不良的患者组具有临床意义。

自2010年以来，发现对于II期和III期进展期胃癌的情况，标准化D2胃切除术后的辅助抗癌疗法提高了胃癌患者的存活率，目前这相当于标准化治疗。传统上，根据其解剖表型和病理表型对胃癌进行分类，根据TNM分期分类为II期或以上的病例接受抗癌治疗，但目前除了TNM分期分类外，没有预测化疗治疗的预后的其他方法可以。

发明内容

技术问题

本发明的目的是提供一种预测进展期胃癌预后的组合物，该组合物基于靶基因群的mRNA表达水平的定量值，从而可以预测进展期胃癌患者(II期和III期：基于ACJJ第6版)的术后预后。

本发明的另一个目的是提供一种就患者存活率方面预测预后提供信息的方法，该方法基于靶基因群的mRNA表达水平的定量值，从而可预测进展期胃癌患者的术后预后。

本发明的又另一个目的是提供一种就患者存活率方面预测预后的方法，该方法基于靶基因群的mRNA表达水平的定量值，从而可预测进展期胃癌患者的术后预后的。

技术方案

根据本发明的一个方面，提供预测II期和III期进展期胃癌预后的组合物，该组合物包含：用于测量靶基因群的mRNA表达水平的试剂，该靶基因群包括TFF1、TFF2、VSIG1、CNN1、NEXN、SCRG1、SORBS1、SPARCL1、AURKA、BUB1、CDC20、CEP55、PTTG1、UBE2C、CD8A、GBP1、GBP5、GZMB、NKG7、WARS、ANTXR1、SFRP4、VCAN、CDH17、CDX1和MYO1A；以及用于测量参照基因群的mRNA表达水平的试剂，该参照基因群包括ACTB、ATP5E、GPX1、UBB和HPRT1。