[发明专利]一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201811650406.9 申请日: 2018-12-31
公开(公告)号: CN109738533B 公开(公告)日: 2022-06-21
发明(设计)人: 黄江铭;曹纬倩;蒋碧云;杨芃原 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: G01N30/02 分类号: G01N30/02;G01N30/08;G01N33/68
代理公司: 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人: 陆飞;陆尤
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 通量 简易 细胞 糖基化位点 富集 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法,其特征在于,具体步骤如下:

(1)通过在细胞培养环境中加入O-GalNAc糖链合成抑制剂,使O-GalNAc糖链合成抑制在单个GalNAc的水平;

(2)然后通过超滤辅助凝集素富集技术实现O-GalNAc糖肽的富集,利用单糖竞争机制释放富集到的O-GalNAc糖肽;其中包括:

(a)加入PNGase F和唾液酸酶去除N-糖链和唾液酸;

(b)用C18小柱对酶解后的肽段除盐,随后冻干;

(c)将凝集素与除盐后的肽段一起孵育;

(d)将孵育后的凝集素溶液转移至超滤管,进行超滤,并清洗5次以上,洗去未与凝集素结合的非糖蛋肽;

(e)在体系中加入终浓度0.1~1mol/L的GalNAc,孵育0.5~2 h,通过单糖竞争作用,将与凝集素结合的O-GalNAc糖肽释放下来;

所述凝集素为长柔毛野豌豆外源凝集素;

(3)最后通过LC-MS,高通量鉴定O-GalNAc糖基化位点;

O-GalNAc糖链合成抑制剂为Benzyl2-acetamido-2-deoxy–α -D-galactopyranoside;

流程(1)中加入抑制剂的浓度为1~10mM;

流程(2)中,细胞在抑制剂环境下培养的时间为24~48h。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,具体操作流程为:

(1)将O-GalNAc糖链合成抑制剂加入细胞培养基中;

(2)细胞在含抑制剂的培养基中培养;

(3)弃去培养基,用PBS清洗3次后进行常规的细胞收集、蛋白裂解和胰酶酶解;

(4)加入PNGase F和唾液酸酶去除N-糖链和唾液酸;

(5)用C18小柱对酶解后的肽段除盐,随后冻干;

(6)将凝集素与除盐后的肽段一起孵育;

(7)将孵育后的凝集素溶液转移至超滤管,进行超滤,并清洗5次以上,洗去未与凝集素结合的非糖蛋肽;

(8)在体系中加入终浓度0.1~1mol/L的GalNAc,孵育0.5~2 h,通过单糖竞争作用,将与凝集素结合的O-GalNAc糖肽释放下来;

(9)超滤,并清洗2~5次,合并收集的O-GalNAc糖肽和GalNAc的混合溶液;

(10)通过C18小柱除盐除去体系中的盐和GalNAc,随后冻干;

(11)做LC-MS分析,鉴定O-GalNAc糖基化位点。

3. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,流程(4)中,加入的PNGase F和唾液酸酶以300~500 U对应1 mg起始蛋白的比例加入,37℃孵育14~18小时。

4. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,流程(6)中,凝集素加入的浓度为1~5 微克/微升;室温孵育,孵育时间为0.5~3 h,孵育以及超滤的溶液为10~100 mMTris/HCl pH为7~8,0~2mM MnCl 2 , 0~2mM CaCl 2 , 0~2 MNaCl。

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