[发明专利]一种重叠延伸PCR结合Sanger测序检测不连续多DNA位点的方法有效
申请号: | 201811642890.0 | 申请日: | 2018-12-29 |
公开(公告)号: | CN110157781B | 公开(公告)日: | 2020-08-21 |
发明(设计)人: | 郑焱;陈佩璇;卢炫廷;邱美兰;谢龙旭;邱雪莲;吴丹叶;徐爱娟 | 申请(专利权)人: | 广州凯普医药科技有限公司;广州凯普医学检验所有限公司;广州凯普生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 任重 |
地址: | 510000 广东省广州市黄埔区九*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 重叠 延伸 pcr 结合 sanger 检测 连续 dna 方法 | ||
1.一种多DNA片段PCR扩增的方法,其特征在于,利用一种用于重叠延伸PCR的引物组合进行PCR扩增,所述引物组合,包括一对用于重叠延伸PCR的通用全长扩增的引物和扩增各目的片段的片段扩增引物,用于重叠延伸PCR的通用全长扩增的引物,其核苷酸序列如SEQID No.1~2所示;
最上游的扩增片段的5’端上游片段扩增引物为该片段的常规设计的上游引物的5’端加上核苷酸序列如SEQ ID No.1所示序列,
其余的扩增片段的5’端上游片段扩增引物为该片段的常规设计的上游引物5’端加上其上游的目的片段3’端的碱基18~23个碱基,
最上游的扩增片段的3’端下游片段扩增引物为常规设计的下游引物5’端加上核苷酸序列如SEQ ID No.2所示序列;
其余扩增片段的3’端下游片段扩增引物为常规设计的下游引物的,
其中所述常规设计的上游引物和下游引物与权利要1所述引物Tm值相差3~8℃;
所述方法PCR扩增的体系为:GeneAmpTM 10×PCR BufferI 3μl,25mM Mg2+ 2.5μl,25mMdNTPs 0.3μl,每条引物各1μl,Roche Taq酶0.5μl,模板1μl,H2O补足至25μl;
所述方法PCR扩增的程序为:95℃ 9min;95℃ 30s,52℃ 30s,72℃ 30s,10个循环;95℃ 30s,58℃ 30s,72℃ 45s,30个循环;72℃ 5min;16℃ ∞。
2.一种多DNA片段PCR扩增的试剂盒,其特征在于,包括一种用于重叠延伸PCR的引物组合进行PCR扩增,所述引物组合,包括一对用于重叠延伸PCR的通用全长扩增的引物和扩增各目的片段的片段扩增引物,用于重叠延伸PCR的通用全长扩增的引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.1~2所示;
最上游的扩增片段的5’端上游片段扩增引物为该片段的常规设计的上游引物的5’端加上核苷酸序列如SEQ ID No.1所示序列,
其余的扩增片段的5’端上游片段扩增引物为该片段的常规设计的上游引物5’端加上其上游的目的片段3’端的碱基18~23个碱基,
最上游的扩增片段的3’端下游片段扩增引物为常规设计的下游引物5’端加上核苷酸序列如SEQ ID No.2所示序列;
其余扩增片段的3’端下游片段扩增引物为常规设计的下游引物的,
其中所述常规设计的上游引物和下游引物与权利要1所述引物Tm值相差3~8℃;
还包括PCR反应的试剂:GeneAmpTM 10×PCR Buffer I、25mM Mg2+、25mM dNTPs、RocheTaq酶、H2O;
PCR扩增的体系为:GeneAmpTM 10×PCR Buffer I 3μl,25mM Mg2+ 2.5μl,25mM dNTPs0.3μl,每条引物各1μl,Roche Taq酶0.5μl,模板1μl,H2O补足至25μl;
PCR扩增的程序为:95℃ 9min;95℃ 30s,52℃ 30s,72℃ 30s,10个循环;95℃ 30s,58℃ 30s,72℃ 45s,30个循环;72℃ 5min;16℃ ∞。
3.一种多DNA片段位点检测的方法,其特征在于,用权利要求1所述方法进行多DNA片段PCR扩增后,用核苷酸序列如SEQ ID No.1~2所示引物进行的Sanger测序。
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