[发明专利]一种与苏淮猪中性洗涤纤维消化率相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与苏淮猪中性洗涤纤维消化率相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记位于猪12号染色体上，所述SNP标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪12号染色体上g.622808核苷酸位点，且具有为A/G多态性，所述SNP标记与苏淮猪中性洗涤纤维消化率极显著相关。一种用于检测所述的SNP标记的引物对，上游引物为：SEQ ID NO：2，下游引物为：SEQ ID NO：3。本发明提供的SNP标记与苏淮猪的中性洗涤纤维消化率相关，可以通过鉴定该SNP标记来筛选有较高的中性洗涤纤维消化率的苏淮猪群体。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，涉及一种与苏淮猪中性洗涤纤维消化率相关的SNP标记及其应用。

背景技术

中性洗涤纤维消化率水平是衡量猪对纤维消化的重要指标之一，并直接影响我国节粮、减排、高效养猪业的可持续发展。近年来，随着对日粮纤维理化特性和营养生理作用研究的深入，研究发现日粮纤维在增强猪的健康和维持胃肠道的微生态平衡方面具有重要的作用。地方品种猪具有耐粗饲的特性，且在长期饲喂过程中形成了使用纤维性饲料的习惯，而含有地方猪血统的合成品种是否继承了这一种质特性、是否降低了纤维性饲料的消化率还都未知。

苏淮猪是由淮安市淮阴种猪场、南京农业大学、江苏省畜牧总站和淮安市农业委员会等单位与1998年开始培育，2011年3月25日获得国家畜禽遗传资源委员会授予的新品种证书。苏淮猪是在新淮猪基础上再导入大白猪血统，通过横交、多世代选育而成，含新淮猪血统50％，大白猪血统50％。苏淮猪培育以来研究人员围绕苏淮猪耐粗饲做了一些研究，发现苏淮猪继承了中国地方猪种淮猪的耐粗饲特性，利用纤维能力较强。但限于研究方法、手段、材料及耐粗饲性状本身复杂性等众多因素的制约，苏淮猪猪种耐粗饲遗传机制并没有得到充分的揭示和有效的利用。

另外，值得注意的是，中国是养猪大国，而且养猪规模还在不断的增加，饲料用粮已经成为粮食主要用途之一，这进一步加剧了人畜争粮的危机。中国纤维资源丰富，在猪日粮中添加纤维不仅能节约粮食、在一定程度上解决人畜争粮问题，而且还能改善动物胃肠道微生物区系、提高动物福利。因此，通过鉴别苏淮猪中性洗涤纤维消化率变异的基因和标记，进一步提升苏淮猪的中性洗涤纤维消化率，对选育有较高的中性洗涤纤维消化率的群体具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供与苏淮猪粗纤维消化率相关的SNP标记。

本发明的另一个目的在于提供用于检测上述SNP标记的引物和检测方法。

本发明的另一个目的在于提供上述SNP标记的用途。

一种与苏淮猪中性洗涤纤维消化率相关的SNP标记，所述SNP标记位于国际猪基因组11.1版本参考序列猪12号染色体上g.622808核苷酸位点，且具有为A/G多态性，所述SNP标记与苏淮猪中性洗涤纤维消化率极显著相关。该位点具有AA基因型的苏淮猪中性洗涤纤维消化率显著高于具有GG基因型的苏淮猪中性洗涤纤维消化率。

一种基于本发明所述的SNP开发分子标记的方法，以含有本发明所述的SNP标记的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以苏淮猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，使本发明所述的SNP标记转化为分子标记。

其中，所述的引物对序列为上游引物：SEQ ID NO：2，下游引物：SEQ ID NO：3；所述的分子标记序列如SEQ ID NO：1所示，所述的SNP位点位于第422位，存在A/G多态性。

按照本发明上述方法得到的分子标记。

所述的分子标记优选序列如SEQ ID NO：1所示，所述的SNP位点位于第422位，存在A/G多态性。

一种用于检测所述的SNP标记的引物对，上游引物为：SEQ ID NO：2，下游引物为：SEQ ID NO：3。