[发明专利]马凡综合征致病基因突变及基于此基因突变的诊断试剂在审
申请号: | 201811608611.9 | 申请日: | 2018-12-27 |
公开(公告)号: | CN109456978A | 公开(公告)日: | 2019-03-12 |
发明(设计)人: | 吴南;吴志宏;林茂;赵森 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院北京协和医院 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/6883 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 朱萍;孟祥斌 |
地址: | 100730 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 综合征 突变 基因突变 致病基因 二代测序技术 分子诊断 早期筛查 诊断试剂 优生优育 携带 发现 研究 | ||
本发明公开了一种马凡综合征相关的基因突变。本发明通过二代测序技术首次发现了c.7785delC(p.Tyr2596Thrfs*86)突变可以导致马凡综合征。本发明的研究成果一方面可以用于早期筛查马凡综合征致病基因突变携带者,提供优生优育指导,另一方面可为马凡综合征患者提供分子诊断依据。
技术领域
本发明属于医学诊断领域,涉及一种马凡综合征致病基因突变及基于此基因突变的诊断试剂。
背景技术
Fibrillin-1(FBN1)基因编码大的糖蛋白,这些糖蛋白构成一大群细胞外蛋白,形成高度组织、扩展和普遍分布的聚集体(微纤维)的核心。与弹性纤维相关的自发和遗传结缔组织疾病光谱强调了原纤蛋白微纤维的重要意义。原纤维蛋白-1的主要构建组件包含47个表皮生长因子样(EGF)结构域,每个结构域由6个高度保守的半胱氨酸残基和7个转化生长因子-β结合蛋白样(TGFBP)结构域组成,其特征在于具有8个半胱氨酸残基。在这些EGF结构域中,43个是钙结合型(cb EGF)。此外,对微纤维组装有显著作用的原纤维蛋白-1和配体的相互作用是由cbEGF结构域介导的,而TGFBP结构域参与了各个原纤维蛋白-1分子间链间二硫键的形成。富含纤维蛋白的微纤维与基底膜和弹性纤维相互作用,为细胞外基质提供稳定性。
马凡综合征(MFS)是指由于染色体15q21上原纤维蛋白-1基因(FBN1)杂合突变导致的纤维结缔组织常染色体显性遗传疾病。允许临床诊断的表型特征主要发生在骨骼,眼睛和心血管系统。MFS的全球流行率约为每10万人2-3例,没有性别或种族倾向。MFS表现为高身材,不成比例的长肢和足趾,前胸壁畸形,轻度至中度关节松弛和频繁脊柱畸形(尤其是脊柱侧凸和胸椎前凸),以及主动脉根扩张和/或分解、晶状体移位。
本申请利用测序技术鉴定了引发马凡综合征的FBN1基因上存在的具体突变,为临床诊断马凡综合征提供了新的分子标志物。
发明内容
本发明的研究思路如下:首先利用二代测序筛选与马凡综合征相关的致病基因突变,为了避免假阳性结果出现,之后通过Sanger测序进行验证,最终获得了一个马凡综合征致病基因突变,突变是FBN1基因c.7785delC。
本发明筛选的致病基因突变中可以将马凡综合征患者和正常人群区分分开,因此,本发明的致病基因突变可以作为诊断马凡综合征的生物标志物。
具体的,本发明提供了一种马凡综合征相关的基因突变,所述基因突变是FBN1基因上的突变。
进一步,所述突变位点是FBN1基因c.7785位,所述突变是c.7785delC。
本发明还提供了一种用于诊断马凡综合征的试剂,所述试剂是检测前面所述的基因突变的试剂。
现有技术中对基因突变位点基因型的检测,可以采用各种常规方法,如DNA测序、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、单链构象多态性(SSCP)、等位基因特异的寡聚核苷酸杂交(ASO)。因此本发明前面所述的试剂包括上述方法中使用到的试剂。
优选地,所述试剂包括含有前面所述的基因突变位点在内的核酸序列的特异性扩增引物。
进一步,所述试剂还可以包括PCR扩增反应中的其他常规试剂,和/或DNA提取过程中使用的试剂,和/或DNA测序过程中使用的试剂。
进一步,所述PCR扩增反应中的其他常规试剂包括但不限于dNTP,PCR缓冲液,镁离子,Tap聚合酶等。
本发明提供了前面所述的基因突变在制备前面所述的试剂中的应用。本领域技术人员根据基因突变位点上下游序列设计特异性扩增引物或者特异性检测探针。引物和探针的设计方法是本领域的常规技术。
本发明还提供了前面所述的基因突变在制备马凡综合征诊断试剂盒中的应用。
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