[发明专利]基因标志物在帕金森诊断中的应用在审
申请号: | 201811584218.0 | 申请日: | 2018-12-24 |
公开(公告)号: | CN109337975A | 公开(公告)日: | 2019-02-15 |
发明(设计)人: | 潘伟;鲍景蕾;王永红 | 申请(专利权)人: | 潘伟 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 高倩倩;李红伟 |
地址: | 252600 山东省聊*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 帕金森 基因标志物 诊断 高通量测序技术 应用 表达下调 提示 下调 验证 发现 | ||
本发明公开了基因标志物在帕金森诊断中的应用,本发明通过高通量测序技术首次发现了LOC105374334在帕金森患者中表达下调,并通过QPCR进一步验证了LOC105374334在帕金森患者中的表达显著下调,提示LOC105374334可以作为基因标志物应用于帕金森的诊断。
技术领域
本发明属于生物医药领域,涉及基因标志物在帕金森诊断中的应用,具体地涉及基因标志物LOC105374334。
背景技术
帕金森病(Parkinson's Disease,PD)是最常见的慢性神经退行性运动障碍疾病之一,其发病率仅次于阿尔茨海默病。随着人口老龄化的加重及平均寿命的延长,PD患者的数量逐渐增加,这无疑将给家庭和社会带来沉重的负担。然而,PD的发病机制目前仍不明确。现有的药物、外科手术治疗虽可缓解症状,但并不能减缓甚至是阻止PD的进展,因此深入了解PD分子学发病机制不但有助于开拓新的治疗靶标,还有望发现早期诊断的敏感指标,对实现PD的早期发现、诊断、治疗均具有重要意义。
长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA,是近年来转录和表观遗传调控网络的另一重要发现。它虽然保守性较低,但其表达具有高度的组织、时空甚至是疾病特异性。目前根据lncRNA与邻近蛋白编码基因的位置关系,将其分为5种类型:大基因间非编码RNA(lincRNA)、内含子非编码RNA、反义非编码RNA、假基因非编码RNA以及增强子非编码RNA,如此丰富的RNA类型奠定了lncRNA能以不同的调控模式调控一系列分子细胞功能的重要基础。随着对长链非编码RNA的研究逐渐深入,人们发现1ncRNA不仅是细胞生理功能、正常大脑发育、免疫炎症反应等的重要调控因子,也是各种疾病如癌症、神经退行性病变等发生发展的重要影响因素。目前,已有多项研究证实lncRNA的异常表达与帕金森病的调控密切相关。例如,CN201810167670.0、CN201810168896.2利用测序,筛选出与帕金森相关的基因。LncRNA能通过多种不同的机制(如介导下游信号、募集染色质重塑复合物等)在表观遗传、转录、转录后以及翻译各个水平全面调控基因表达。随着研究逐渐深入,越来越多的研究表明,lncRNA调控网络的平衡是机体维持正常生理功能的重要保障。研究与帕金森相关的生物指标,有可能在将来为帕金森的风险提前预估提供一个新的生物指标,从而为帕金森的诊断和检测以及筛选出易感个体实现早期预防治疗具有重要的意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种与帕金森相关的基因标志物及其应用,通过检测标志物的水平,可以在帕金森的早期进行预警,进行疾病的早期干预以及治疗,提高患者的生活质量,加强防护。
本发明提供了检测LOC105374334的试剂在制备诊断帕金森的产品中的应用。
进一步,所述试剂包括:通过反转录PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片或高通量测序平台检测样本中LOC105374334基因表达水平的试剂。
进一步,所述用实时定量PCR检测LOC105374334基因表达水平的试剂至少包括一对特异性扩增LOC105374334基因的引物。
进一步,所述特异性扩增LOC105374334基因的引物序列如SEQ ID NO.1~2所示。
进一步,所述样本选自人外周血。
本发明提供了一种体外检测LOC105374334表达水平的产品,所述产品包括芯片、制剂或试剂盒。
进一步,所述所述芯片包括:固相载体;以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针特异性地对应于LOC105374334的部分或全部序列。
进一步,所述试剂盒包括特异性检测LOC105374334的探针、基因芯片或引物。
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